Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFNA3P52797 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFNA3P52797 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EFNA3P52797 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFNA3P52797 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFNA3P52797 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFNA3P52797 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFNA3P52797 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFNA3P52797 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFNA3P52797 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EFNA3P52797 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EFNA3P52797 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFNA3P52797 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFNA3P52797 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFNA3P52797 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EFNA3P52797 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFNA3P52797 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
EFNA3P52797 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFNA3P52797 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFNA3P52797 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFNA3P52797 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFNA3P52797 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFNA3P52797 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EFNA3P52797 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFNA3P52797 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EFNA3P52797 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFNA3P52797 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EFNA3P52797 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EFNA3P52797 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFNA3P52797 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFNA3P52797 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFNA3P52797 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EFNA3P52797 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EFNA3P52797 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EFNA3P52797 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EFNA3P52797 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EFNA3P52797 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EFNA3P52797 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EFNA3P52797 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EFNA3P52797 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EFNA3P52797 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EFNA3P52797 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EFNA3P52797 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EFNA3P52797 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFNA3P52797 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFNA3P52797 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFNA3P52797 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFNA3P52797 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFNA3P52797 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFNA3P52797 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFNA3P52797 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFNA3P52797 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFNA3P52797 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EFNA3P52797 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EFNA3P52797 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EFNA3P52797 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EFNA3P52797 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EFNA3P52797 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFNA3P52797 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFNA3P52797 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFNA3P52797 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFNA3P52797 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFNA3P52797 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFNA3P52797 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EFNA3P52797 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EFNA3P52797 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFNA3P52797 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFNA3P52797 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFNA3P52797 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFNA3P52797 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFNA3P52797 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFNA3P52797 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFNA3P52797 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFNA3P52797 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFNA3P52797 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFNA3P52797 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFNA3P52797 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFNA3P52797 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFNA3P52797 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFNA3P52797 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFNA3P52797 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EFNA3P52797 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFNA3P52797 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFNA3P52797 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EFNA3P52797 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFNA3P52797 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFNA3P52797 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFNA3P52797 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFNA3P52797 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFNA3P52797 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFNA3P52797 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFNA3P52797 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFNA3P52797 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFNA3P52797 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFNA3P52797 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFNA3P52797 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFNA3P52797 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFNA3P52797 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFNA3P52797 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EFNA3P52797 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms