Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RND2P52198 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RND2P52198 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RND2P52198 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RND2P52198 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RND2P52198 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RND2P52198 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RND2P52198 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RND2P52198 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RND2P52198 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RND2P52198 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RND2P52198 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RND2P52198 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RND2P52198 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RND2P52198 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RND2P52198 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RND2P52198 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RND2P52198 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RND2P52198 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RND2P52198 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RND2P52198 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RND2P52198 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RND2P52198 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RND2P52198 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RND2P52198 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RND2P52198 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RND2P52198 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RND2P52198 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RND2P52198 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RND2P52198 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RND2P52198 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RND2P52198 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RND2P52198 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RND2P52198 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RND2P52198 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RND2P52198 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RND2P52198 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RND2P52198 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RND2P52198 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RND2P52198 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RND2P52198 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RND2P52198 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RND2P52198 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RND2P52198 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RND2P52198 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RND2P52198 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RND2P52198 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RND2P52198 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RND2P52198 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RND2P52198 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RND2P52198 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RND2P52198 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RND2P52198 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RND2P52198 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RND2P52198 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RND2P52198 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RND2P52198 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RND2P52198 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RND2P52198 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RND2P52198 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RND2P52198 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RND2P52198 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RND2P52198 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RND2P52198 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RND2P52198 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RND2P52198 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RND2P52198 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RND2P52198 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RND2P52198 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RND2P52198 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RND2P52198 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RND2P52198 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RND2P52198 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RND2P52198 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RND2P52198 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RND2P52198 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RND2P52198 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RND2P52198 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RND2P52198 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RND2P52198 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RND2P52198 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RND2P52198 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RND2P52198 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RND2P52198 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RND2P52198 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RND2P52198 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RND2P52198 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RND2P52198 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RND2P52198 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RND2P52198 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RND2P52198 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RND2P52198 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RND2P52198 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RND2P52198 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RND2P52198 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RND2P52198 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RND2P52198 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RND2P52198 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RND2P52198 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RND2P52198 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms