Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLCN5P51795 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLCN5P51795 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLCN5P51795 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLCN5P51795 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLCN5P51795 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLCN5P51795 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CLCN5P51795 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLCN5P51795 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLCN5P51795 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLCN5P51795 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLCN5P51795 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLCN5P51795 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLCN5P51795 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLCN5P51795 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLCN5P51795 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLCN5P51795 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLCN5P51795 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLCN5P51795 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CLCN5P51795 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLCN5P51795 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLCN5P51795 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLCN5P51795 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CLCN5P51795 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLCN5P51795 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLCN5P51795 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLCN5P51795 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLCN5P51795 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLCN5P51795 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CLCN5P51795 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLCN5P51795 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CLCN5P51795 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLCN5P51795 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLCN5P51795 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CLCN5P51795 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLCN5P51795 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLCN5P51795 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CLCN5P51795 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLCN5P51795 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CLCN5P51795 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLCN5P51795 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLCN5P51795 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLCN5P51795 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLCN5P51795 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLCN5P51795 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLCN5P51795 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLCN5P51795 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLCN5P51795 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLCN5P51795 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLCN5P51795 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLCN5P51795 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLCN5P51795 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLCN5P51795 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLCN5P51795 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLCN5P51795 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLCN5P51795 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLCN5P51795 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLCN5P51795 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLCN5P51795 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLCN5P51795 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLCN5P51795 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLCN5P51795 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLCN5P51795 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLCN5P51795 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CLCN5P51795 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLCN5P51795 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLCN5P51795 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLCN5P51795 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLCN5P51795 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLCN5P51795 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLCN5P51795 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLCN5P51795 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLCN5P51795 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLCN5P51795 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLCN5P51795 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLCN5P51795 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLCN5P51795 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLCN5P51795 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLCN5P51795 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCN5P51795 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCN5P51795 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCN5P51795 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCN5P51795 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCN5P51795 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCN5P51795 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CLCN5P51795 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLCN5P51795 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLCN5P51795 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLCN5P51795 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLCN5P51795 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLCN5P51795 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CLCN5P51795 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLCN5P51795 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLCN5P51795 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLCN5P51795 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLCN5P51795 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLCN5P51795 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLCN5P51795 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLCN5P51795 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLCN5P51795 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms