Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.07■■■■■ 6.25
SMARCA4P51532 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC54.05■■■■■ 6.24
SMARCA4P51532 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC54.04■■■■■ 6.24
SMARCA4P51532 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC53.99■■■■■ 6.23
SMARCA4P51532 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC53.98■■■■■ 6.23
SMARCA4P51532 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.97■■■■■ 6.23
SMARCA4P51532 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.93■■■■■ 6.22
SMARCA4P51532 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC53.91■■■■■ 6.22
SMARCA4P51532 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.91■■■■■ 6.22
SMARCA4P51532 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC53.87■■■■■ 6.21
SMARCA4P51532 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC53.86■■■■■ 6.21
SMARCA4P51532 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC53.85■■■■■ 6.21
SMARCA4P51532 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.84■■■■■ 6.21
SMARCA4P51532 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC53.74■■■■■ 6.19
SMARCA4P51532 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC53.73■■■■■ 6.19
SMARCA4P51532 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC53.71■■■■■ 6.19
SMARCA4P51532 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC53.71■■■■■ 6.19
SMARCA4P51532 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
SMARCA4P51532 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC53.63■■■■■ 6.18
SMARCA4P51532 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.57■■■■■ 6.17
SMARCA4P51532 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC53.55■■■■■ 6.16
SMARCA4P51532 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.53■■■■■ 6.16
SMARCA4P51532 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.5■■■■■ 6.16
SMARCA4P51532 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
SMARCA4P51532 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC53.36■■■■■ 6.13
SMARCA4P51532 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC53.31■■■■■ 6.13
SMARCA4P51532 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.31■■■■■ 6.12
SMARCA4P51532 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.3■■■■■ 6.12
SMARCA4P51532 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC53.29■■■■■ 6.12
SMARCA4P51532 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC53.27■■■■■ 6.12
SMARCA4P51532 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.27■■■■■ 6.12
SMARCA4P51532 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.26■■■■■ 6.12
SMARCA4P51532 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC53.24■■■■■ 6.11
SMARCA4P51532 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC53.24■■■■■ 6.11
SMARCA4P51532 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC53.2■■■■■ 6.11
SMARCA4P51532 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC53.2■■■■■ 6.11
SMARCA4P51532 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.09■■■■■ 6.09
SMARCA4P51532 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC53.09■■■■■ 6.09
SMARCA4P51532 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.06■■■■■ 6.09
SMARCA4P51532 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC53.04■■■■■ 6.08
SMARCA4P51532 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.04■■■■■ 6.08
SMARCA4P51532 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.97■■■■■ 6.07
SMARCA4P51532 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC52.96■■■■■ 6.07
SMARCA4P51532 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC52.95■■■■■ 6.07
SMARCA4P51532 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
SMARCA4P51532 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.93■■■■■ 6.06
SMARCA4P51532 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC52.91■■■■■ 6.06
SMARCA4P51532 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC52.88■■■■■ 6.06
SMARCA4P51532 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC52.88■■■■■ 6.06
SMARCA4P51532 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC52.84■■■■■ 6.05
SMARCA4P51532 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC52.78■■■■■ 6.04
SMARCA4P51532 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC52.77■■■■■ 6.04
SMARCA4P51532 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.77■■■■■ 6.04
SMARCA4P51532 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
SMARCA4P51532 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.03
SMARCA4P51532 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.74■■■■■ 6.03
SMARCA4P51532 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC52.73■■■■■ 6.03
SMARCA4P51532 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.62■■■■■ 6.01
SMARCA4P51532 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.54■■■■■ 6
SMARCA4P51532 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC52.5■■■■■ 5.99
SMARCA4P51532 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.47■■■■■ 5.99
SMARCA4P51532 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC52.44■■■■■ 5.99
SMARCA4P51532 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC52.43■■■■■ 5.98
SMARCA4P51532 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.42■■■■■ 5.98
SMARCA4P51532 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
SMARCA4P51532 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC52.33■■■■■ 5.97
SMARCA4P51532 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC52.32■■■■■ 5.97
SMARCA4P51532 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
SMARCA4P51532 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC52.28■■■■■ 5.96
SMARCA4P51532 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC52.26■■■■■ 5.96
SMARCA4P51532 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC52.26■■■■■ 5.96
SMARCA4P51532 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC52.24■■■■■ 5.95
SMARCA4P51532 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.23■■■■■ 5.95
SMARCA4P51532 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.22■■■■■ 5.95
SMARCA4P51532 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC52.21■■■■■ 5.95
SMARCA4P51532 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.2■■■■■ 5.95
SMARCA4P51532 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC52.18■■■■■ 5.94
SMARCA4P51532 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
SMARCA4P51532 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
SMARCA4P51532 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.15■■■■■ 5.94
SMARCA4P51532 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC52.08■■■■■ 5.93
SMARCA4P51532 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC52.05■■■■■ 5.92
SMARCA4P51532 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.05■■■■■ 5.92
SMARCA4P51532 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.04■■■■■ 5.92
SMARCA4P51532 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.04■■■■■ 5.92
SMARCA4P51532 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
SMARCA4P51532 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC52■■■■■ 5.91
SMARCA4P51532 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.97■■■■■ 5.91
SMARCA4P51532 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC51.97■■■■■ 5.91
SMARCA4P51532 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC51.94■■■■■ 5.91
SMARCA4P51532 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
SMARCA4P51532 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC51.92■■■■■ 5.9
SMARCA4P51532 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.91■■■■■ 5.9
SMARCA4P51532 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC51.9■■■■■ 5.9
SMARCA4P51532 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.88■■■■■ 5.9
SMARCA4P51532 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC51.87■■■■■ 5.89
SMARCA4P51532 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
SMARCA4P51532 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
SMARCA4P51532 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC51.82■■■■■ 5.89
SMARCA4P51532 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.81■■■■■ 5.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms