Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPT1P50897 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPT1P50897 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPT1P50897 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPT1P50897 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPT1P50897 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPT1P50897 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPT1P50897 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPT1P50897 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPT1P50897 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPT1P50897 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPT1P50897 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPT1P50897 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPT1P50897 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPT1P50897 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT1P50897 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT1P50897 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPT1P50897 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPT1P50897 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPT1P50897 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPT1P50897 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPT1P50897 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPT1P50897 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPT1P50897 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPT1P50897 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPT1P50897 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPT1P50897 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPT1P50897 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPT1P50897 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPT1P50897 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPT1P50897 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPT1P50897 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPT1P50897 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPT1P50897 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPT1P50897 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPT1P50897 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPT1P50897 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPT1P50897 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPT1P50897 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPT1P50897 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPT1P50897 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPT1P50897 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPT1P50897 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPT1P50897 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPT1P50897 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPT1P50897 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPT1P50897 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPT1P50897 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPT1P50897 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPT1P50897 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPT1P50897 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPT1P50897 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPT1P50897 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPT1P50897 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPT1P50897 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPT1P50897 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPT1P50897 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPT1P50897 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPT1P50897 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPT1P50897 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPT1P50897 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPT1P50897 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPT1P50897 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPT1P50897 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPT1P50897 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPT1P50897 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPT1P50897 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPT1P50897 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPT1P50897 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPT1P50897 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPT1P50897 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPT1P50897 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPT1P50897 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPT1P50897 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPT1P50897 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPT1P50897 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPT1P50897 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPT1P50897 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPT1P50897 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPT1P50897 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPT1P50897 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPT1P50897 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPT1P50897 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPT1P50897 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPT1P50897 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPT1P50897 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPT1P50897 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPT1P50897 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPT1P50897 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPT1P50897 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPT1P50897 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPT1P50897 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPT1P50897 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPT1P50897 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPT1P50897 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPT1P50897 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPT1P50897 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPT1P50897 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPT1P50897 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPT1P50897 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms