Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB3P49720 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB3P49720 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB3P49720 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMB3P49720 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB3P49720 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB3P49720 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB3P49720 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB3P49720 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMB3P49720 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMB3P49720 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB3P49720 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB3P49720 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB3P49720 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB3P49720 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB3P49720 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB3P49720 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB3P49720 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB3P49720 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB3P49720 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB3P49720 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB3P49720 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB3P49720 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB3P49720 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB3P49720 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB3P49720 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB3P49720 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB3P49720 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB3P49720 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB3P49720 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB3P49720 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB3P49720 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB3P49720 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMB3P49720 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB3P49720 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB3P49720 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB3P49720 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB3P49720 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB3P49720 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB3P49720 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB3P49720 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB3P49720 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB3P49720 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB3P49720 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB3P49720 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB3P49720 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB3P49720 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB3P49720 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB3P49720 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB3P49720 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB3P49720 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB3P49720 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB3P49720 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB3P49720 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB3P49720 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB3P49720 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB3P49720 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB3P49720 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB3P49720 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB3P49720 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB3P49720 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB3P49720 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB3P49720 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB3P49720 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB3P49720 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB3P49720 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB3P49720 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB3P49720 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB3P49720 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB3P49720 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB3P49720 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB3P49720 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB3P49720 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB3P49720 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB3P49720 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB3P49720 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB3P49720 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB3P49720 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB3P49720 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB3P49720 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB3P49720 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB3P49720 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB3P49720 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB3P49720 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB3P49720 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB3P49720 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB3P49720 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB3P49720 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB3P49720 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB3P49720 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB3P49720 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB3P49720 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB3P49720 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB3P49720 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB3P49720 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB3P49720 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB3P49720 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB3P49720 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB3P49720 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB3P49720 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms