Protein–RNA interactions for Protein: P49585

PCYT1A, Choline-phosphate cytidylyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1AP49585 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCYT1AP49585 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCYT1AP49585 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCYT1AP49585 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCYT1AP49585 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCYT1AP49585 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCYT1AP49585 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCYT1AP49585 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCYT1AP49585 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCYT1AP49585 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCYT1AP49585 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCYT1AP49585 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCYT1AP49585 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCYT1AP49585 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCYT1AP49585 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCYT1AP49585 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCYT1AP49585 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCYT1AP49585 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCYT1AP49585 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCYT1AP49585 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCYT1AP49585 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCYT1AP49585 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCYT1AP49585 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCYT1AP49585 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCYT1AP49585 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCYT1AP49585 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCYT1AP49585 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCYT1AP49585 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCYT1AP49585 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCYT1AP49585 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCYT1AP49585 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCYT1AP49585 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCYT1AP49585 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCYT1AP49585 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCYT1AP49585 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCYT1AP49585 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCYT1AP49585 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCYT1AP49585 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCYT1AP49585 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PCYT1AP49585 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCYT1AP49585 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCYT1AP49585 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCYT1AP49585 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCYT1AP49585 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCYT1AP49585 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCYT1AP49585 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCYT1AP49585 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCYT1AP49585 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCYT1AP49585 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCYT1AP49585 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCYT1AP49585 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCYT1AP49585 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms