Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCT5P48643 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCT5P48643 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCT5P48643 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCT5P48643 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCT5P48643 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCT5P48643 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCT5P48643 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCT5P48643 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCT5P48643 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCT5P48643 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCT5P48643 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCT5P48643 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCT5P48643 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCT5P48643 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCT5P48643 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCT5P48643 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCT5P48643 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCT5P48643 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCT5P48643 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCT5P48643 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCT5P48643 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCT5P48643 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCT5P48643 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCT5P48643 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCT5P48643 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCT5P48643 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCT5P48643 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCT5P48643 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCT5P48643 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCT5P48643 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCT5P48643 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCT5P48643 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCT5P48643 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCT5P48643 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCT5P48643 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCT5P48643 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCT5P48643 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCT5P48643 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCT5P48643 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCT5P48643 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCT5P48643 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT5P48643 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCT5P48643 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCT5P48643 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCT5P48643 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCT5P48643 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCT5P48643 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCT5P48643 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCT5P48643 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCT5P48643 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCT5P48643 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCT5P48643 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCT5P48643 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCT5P48643 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCT5P48643 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCT5P48643 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCT5P48643 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCT5P48643 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCT5P48643 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCT5P48643 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCT5P48643 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCT5P48643 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT5P48643 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT5P48643 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT5P48643 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT5P48643 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCT5P48643 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCT5P48643 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCT5P48643 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCT5P48643 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCT5P48643 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCT5P48643 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCT5P48643 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCT5P48643 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCT5P48643 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCT5P48643 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT5P48643 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT5P48643 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT5P48643 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT5P48643 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT5P48643 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT5P48643 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCT5P48643 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCT5P48643 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCT5P48643 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCT5P48643 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCT5P48643 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCT5P48643 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCT5P48643 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCT5P48643 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCT5P48643 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCT5P48643 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCT5P48643 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCT5P48643 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCT5P48643 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCT5P48643 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCT5P48643 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCT5P48643 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCT5P48643 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms