Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GdnfP48540 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GdnfP48540 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GdnfP48540 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GdnfP48540 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GdnfP48540 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GdnfP48540 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GdnfP48540 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GdnfP48540 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GdnfP48540 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GdnfP48540 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GdnfP48540 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GdnfP48540 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GdnfP48540 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GdnfP48540 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GdnfP48540 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GdnfP48540 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GdnfP48540 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GdnfP48540 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GdnfP48540 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GdnfP48540 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GdnfP48540 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GdnfP48540 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GdnfP48540 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GdnfP48540 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GdnfP48540 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GdnfP48540 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GdnfP48540 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GdnfP48540 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GdnfP48540 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GdnfP48540 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GdnfP48540 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GdnfP48540 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GdnfP48540 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GdnfP48540 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GdnfP48540 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GdnfP48540 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GdnfP48540 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GdnfP48540 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GdnfP48540 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GdnfP48540 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GdnfP48540 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GdnfP48540 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GdnfP48540 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GdnfP48540 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GdnfP48540 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GdnfP48540 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GdnfP48540 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GdnfP48540 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GdnfP48540 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GdnfP48540 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GdnfP48540 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GdnfP48540 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GdnfP48540 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GdnfP48540 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GdnfP48540 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GdnfP48540 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GdnfP48540 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GdnfP48540 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GdnfP48540 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GdnfP48540 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GdnfP48540 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GdnfP48540 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GdnfP48540 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
GdnfP48540 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GdnfP48540 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GdnfP48540 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GdnfP48540 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GdnfP48540 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GdnfP48540 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GdnfP48540 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GdnfP48540 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GdnfP48540 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GdnfP48540 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GdnfP48540 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GdnfP48540 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GdnfP48540 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GdnfP48540 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GdnfP48540 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GdnfP48540 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GdnfP48540 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GdnfP48540 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GdnfP48540 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GdnfP48540 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GdnfP48540 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GdnfP48540 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GdnfP48540 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GdnfP48540 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GdnfP48540 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GdnfP48540 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GdnfP48540 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GdnfP48540 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GdnfP48540 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GdnfP48540 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GdnfP48540 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GdnfP48540 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GdnfP48540 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GdnfP48540 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GdnfP48540 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GdnfP48540 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms