Protein–RNA interactions for Protein: P48060

GLIPR1, Glioma pathogenesis-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIPR1P48060 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLIPR1P48060 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLIPR1P48060 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLIPR1P48060 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLIPR1P48060 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GLIPR1P48060 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GLIPR1P48060 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLIPR1P48060 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GLIPR1P48060 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GLIPR1P48060 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIPR1P48060 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLIPR1P48060 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLIPR1P48060 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLIPR1P48060 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GLIPR1P48060 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLIPR1P48060 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLIPR1P48060 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLIPR1P48060 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIPR1P48060 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GLIPR1P48060 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIPR1P48060 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIPR1P48060 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIPR1P48060 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIPR1P48060 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIPR1P48060 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIPR1P48060 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLIPR1P48060 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLIPR1P48060 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLIPR1P48060 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLIPR1P48060 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLIPR1P48060 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLIPR1P48060 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLIPR1P48060 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GLIPR1P48060 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLIPR1P48060 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLIPR1P48060 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLIPR1P48060 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLIPR1P48060 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLIPR1P48060 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLIPR1P48060 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLIPR1P48060 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLIPR1P48060 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLIPR1P48060 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLIPR1P48060 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLIPR1P48060 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLIPR1P48060 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLIPR1P48060 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLIPR1P48060 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLIPR1P48060 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLIPR1P48060 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLIPR1P48060 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLIPR1P48060 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLIPR1P48060 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLIPR1P48060 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLIPR1P48060 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLIPR1P48060 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLIPR1P48060 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLIPR1P48060 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLIPR1P48060 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLIPR1P48060 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLIPR1P48060 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLIPR1P48060 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLIPR1P48060 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLIPR1P48060 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLIPR1P48060 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLIPR1P48060 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLIPR1P48060 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLIPR1P48060 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLIPR1P48060 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLIPR1P48060 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLIPR1P48060 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLIPR1P48060 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLIPR1P48060 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLIPR1P48060 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLIPR1P48060 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLIPR1P48060 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLIPR1P48060 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLIPR1P48060 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLIPR1P48060 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLIPR1P48060 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLIPR1P48060 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLIPR1P48060 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLIPR1P48060 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIPR1P48060 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLIPR1P48060 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms