Protein–RNA interactions for Protein: P48016

ATH1, Vacuolar acid trehalase, yeastyeast

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Length 1,211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATH1P48016 BSC6YOL137W 1494 nt12.91□□□□□ -0.34
ATH1P48016 CLB6YGR109C 1143 nt12.91□□□□□ -0.34
ATH1P48016 PTC2YER089C 1395 nt12.9□□□□□ -0.34
ATH1P48016 YCR099CYCR099C 468 nt12.87□□□□□ -0.35
ATH1P48016 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.87□□□□□ -0.35
ATH1P48016 WHI5YOR083W 888 nt12.86□□□□□ -0.35
ATH1P48016 LSM3YLR438C-A 270 nt12.85□□□□□ -0.35
ATH1P48016 AI3Q0060 1248 nt12.81□□□□□ -0.36
ATH1P48016 POA1YBR022W 534 nt12.81□□□□□ -0.36
ATH1P48016 PET20YPL159C 762 nt12.8□□□□□ -0.36
ATH1P48016 Q0142Q0142 177 nt12.78□□□□□ -0.36
ATH1P48016 TOM20YGR082W 552 nt12.78□□□□□ -0.36
ATH1P48016 UTP6YDR449C 1323 nt12.77□□□□□ -0.37
ATH1P48016 LCP5YER127W 1074 nt12.73□□□□□ -0.37
ATH1P48016 FMP45YDL222C 930 nt12.71□□□□□ -0.37
ATH1P48016 INM2YDR287W 879 nt12.71□□□□□ -0.37
ATH1P48016 AI5_BETAQ0075 1065 nt12.68□□□□□ -0.38
ATH1P48016 snR78snR78 87 nt12.67□□□□□ -0.38
ATH1P48016 YBL100CYBL100C 315 nt12.67□□□□□ -0.38
ATH1P48016 NAB2YGL122C 1578 nt12.67□□□□□ -0.38
ATH1P48016 BUD23YCR047C 828 nt12.66□□□□□ -0.38
ATH1P48016 DSK2YMR276W 1122 nt12.66□□□□□ -0.38
ATH1P48016 FPR4YLR449W 1179 nt12.64□□□□□ -0.39
ATH1P48016 TRM9YML014W 840 nt12.64□□□□□ -0.39
ATH1P48016 MRPL8YJL063C 717 nt12.63□□□□□ -0.39
ATH1P48016 IMP2'YIL154C 1041 nt12.62□□□□□ -0.39
ATH1P48016 SKG1YKR100C 1068 nt12.62□□□□□ -0.39
ATH1P48016 URH1YDR400W 1023 nt12.61□□□□□ -0.39
ATH1P48016 YCH1YGR203W 447 nt12.61□□□□□ -0.39
ATH1P48016 DAL1YIR027C 1383 nt12.6□□□□□ -0.39
ATH1P48016 YNR068CYNR068C 819 nt12.59□□□□□ -0.39
ATH1P48016 YPR011CYPR011C 981 nt12.56□□□□□ -0.4
ATH1P48016 YLR236CYLR236C 324 nt12.53□□□□□ -0.4
ATH1P48016 FUN26YAL022C 1554 nt12.52□□□□□ -0.4
ATH1P48016 YPL071CYPL071C 471 nt12.52□□□□□ -0.41
ATH1P48016 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.51□□□□□ -0.41
ATH1P48016 HMT1YBR034C 1047 nt12.5□□□□□ -0.41
ATH1P48016 Q0017Q0017 162 nt12.5□□□□□ -0.41
ATH1P48016 FIS1YIL065C 468 nt12.47□□□□□ -0.41
ATH1P48016 ADO1YJR105W 1023 nt12.47□□□□□ -0.41
ATH1P48016 PHO4YFR034C 939 nt12.46□□□□□ -0.41
ATH1P48016 Q0255Q0255 1419 nt12.44□□□□□ -0.42
ATH1P48016 YPL168WYPL168W 1293 nt12.43□□□□□ -0.42
ATH1P48016 CCT6YDR188W 1641 nt12.42□□□□□ -0.42
ATH1P48016 YGL188CYGL188C 174 nt12.39□□□□□ -0.43
ATH1P48016 YJL118WYJL118W 660 nt12.36□□□□□ -0.43
ATH1P48016 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.35□□□□□ -0.43
ATH1P48016 YEL076CYEL076C 651 nt12.35□□□□□ -0.43
ATH1P48016 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.35□□□□□ -0.43
ATH1P48016 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.35□□□□□ -0.43
ATH1P48016 YLR464WYLR464W 651 nt12.35□□□□□ -0.43
ATH1P48016 YOR169CYOR169C 465 nt12.35□□□□□ -0.43
ATH1P48016 YJL152WYJL152W 360 nt12.34□□□□□ -0.43
ATH1P48016 SPT5YML010W 3192 nt12.33□□□□□ -0.44
ATH1P48016 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt12.33□□□□□ -0.44
ATH1P48016 UBX6YJL048C 1191 nt12.32□□□□□ -0.44
ATH1P48016 URE2YNL229C 1065 nt12.32□□□□□ -0.44
ATH1P48016 LPX1YOR084W 1164 nt12.32□□□□□ -0.44
ATH1P48016 SSA4YER103W 1929 nt12.32□□□□□ -0.44
ATH1P48016 YMR057CYMR057C 372 nt12.31□□□□□ -0.44
ATH1P48016 ALF1YNL148C 765 nt12.31□□□□□ -0.44
ATH1P48016 YHM2YMR241W 945 nt12.28□□□□□ -0.44
ATH1P48016 IDH1YNL037C 1083 nt12.28□□□□□ -0.44
ATH1P48016 AIR1YIL079C 1083 nt12.27□□□□□ -0.45
ATH1P48016 ERV46YAL042W 1248 nt12.27□□□□□ -0.45
ATH1P48016 SPP1YPL138C 1062 nt12.26□□□□□ -0.45
ATH1P48016 ATP6Q0085 780 nt12.25□□□□□ -0.45
ATH1P48016 YDR433WYDR433W 441 nt12.23□□□□□ -0.45
ATH1P48016 SIS1YNL007C 1059 nt12.23□□□□□ -0.45
ATH1P48016 RTG1YOL067C 534 nt12.2□□□□□ -0.46
ATH1P48016 KTR3YBR205W 1215 nt12.19□□□□□ -0.46
ATH1P48016 FPS1YLL043W 2010 nt12.16□□□□□ -0.46
ATH1P48016 YKR040CYKR040C 504 nt12.16□□□□□ -0.46
ATH1P48016 NEM1YHR004C 1341 nt12.14□□□□□ -0.47
ATH1P48016 FTR1YER145C 1215 nt12.12□□□□□ -0.47
ATH1P48016 HUA1YGR268C 597 nt12.09□□□□□ -0.47
ATH1P48016 GBP2YCL011C 1284 nt12.09□□□□□ -0.47
ATH1P48016 NVJ2YPR091C 2313 nt12.09□□□□□ -0.47
ATH1P48016 YJL107CYJL107C 1164 nt12.07□□□□□ -0.48
ATH1P48016 THP3YPR045C 1413 nt12.06□□□□□ -0.48
ATH1P48016 LSM12YHR121W 564 nt12.03□□□□□ -0.48
ATH1P48016 YDR095CYDR095C 411 nt12.02□□□□□ -0.49
ATH1P48016 YPS1YLR120C 1710 nt12.01□□□□□ -0.49
ATH1P48016 YDR094WYDR094W 336 nt12.01□□□□□ -0.49
ATH1P48016 YEL074WYEL074W 339 nt12.01□□□□□ -0.49
ATH1P48016 MXR2YCL033C 507 nt12.01□□□□□ -0.49
ATH1P48016 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt11.98□□□□□ -0.49
ATH1P48016 PAC11YDR488C 1602 nt11.97□□□□□ -0.49
ATH1P48016 TIR4YOR009W 1464 nt11.97□□□□□ -0.49
ATH1P48016 STD1YOR047C 1335 nt11.97□□□□□ -0.49
ATH1P48016 BDF1YLR399C 2061 nt11.95□□□□□ -0.5
ATH1P48016 RSM23YGL129C 1353 nt11.92□□□□□ -0.5
ATH1P48016 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.92□□□□□ -0.5
ATH1P48016 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.9□□□□□ -0.5
ATH1P48016 TCD2YKL027W 1344 nt11.88□□□□□ -0.51
ATH1P48016 CAC2YML102W 1407 nt11.88□□□□□ -0.51
ATH1P48016 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.87□□□□□ -0.51
ATH1P48016 MOD5YOR274W 1287 nt11.87□□□□□ -0.51
ATH1P48016 YPL041CYPL041C 624 nt11.87□□□□□ -0.51
ATH1P48016 YGL118CYGL118C 438 nt11.85□□□□□ -0.51
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