Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALR1P47211 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALR1P47211 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALR1P47211 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALR1P47211 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALR1P47211 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALR1P47211 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALR1P47211 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALR1P47211 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GALR1P47211 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALR1P47211 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALR1P47211 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALR1P47211 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALR1P47211 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALR1P47211 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALR1P47211 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALR1P47211 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALR1P47211 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALR1P47211 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALR1P47211 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALR1P47211 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALR1P47211 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALR1P47211 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALR1P47211 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALR1P47211 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALR1P47211 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALR1P47211 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALR1P47211 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALR1P47211 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALR1P47211 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALR1P47211 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GALR1P47211 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALR1P47211 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALR1P47211 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GALR1P47211 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GALR1P47211 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALR1P47211 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GALR1P47211 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALR1P47211 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALR1P47211 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GALR1P47211 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GALR1P47211 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALR1P47211 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALR1P47211 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GALR1P47211 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GALR1P47211 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GALR1P47211 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GALR1P47211 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GALR1P47211 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GALR1P47211 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GALR1P47211 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALR1P47211 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALR1P47211 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALR1P47211 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GALR1P47211 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALR1P47211 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALR1P47211 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALR1P47211 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GALR1P47211 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALR1P47211 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALR1P47211 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALR1P47211 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALR1P47211 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALR1P47211 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALR1P47211 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GALR1P47211 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALR1P47211 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GALR1P47211 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GALR1P47211 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALR1P47211 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GALR1P47211 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GALR1P47211 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GALR1P47211 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GALR1P47211 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GALR1P47211 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GALR1P47211 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GALR1P47211 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GALR1P47211 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GALR1P47211 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GALR1P47211 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GALR1P47211 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GALR1P47211 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GALR1P47211 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GALR1P47211 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GALR1P47211 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GALR1P47211 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GALR1P47211 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GALR1P47211 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALR1P47211 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GALR1P47211 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GALR1P47211 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GALR1P47211 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GALR1P47211 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GALR1P47211 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GALR1P47211 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GALR1P47211 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALR1P47211 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALR1P47211 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALR1P47211 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GALR1P47211 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms