Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps4bP46467 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vps4bP46467 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps4bP46467 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps4bP46467 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps4bP46467 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vps4bP46467 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps4bP46467 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps4bP46467 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps4bP46467 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps4bP46467 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Vps4bP46467 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps4bP46467 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vps4bP46467 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Vps4bP46467 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps4bP46467 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps4bP46467 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps4bP46467 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps4bP46467 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps4bP46467 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps4bP46467 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps4bP46467 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vps4bP46467 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps4bP46467 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps4bP46467 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps4bP46467 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps4bP46467 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps4bP46467 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps4bP46467 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps4bP46467 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps4bP46467 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps4bP46467 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps4bP46467 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps4bP46467 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps4bP46467 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vps4bP46467 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps4bP46467 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Vps4bP46467 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps4bP46467 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps4bP46467 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps4bP46467 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps4bP46467 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps4bP46467 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps4bP46467 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps4bP46467 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps4bP46467 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps4bP46467 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Vps4bP46467 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps4bP46467 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps4bP46467 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps4bP46467 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps4bP46467 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps4bP46467 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps4bP46467 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps4bP46467 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps4bP46467 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps4bP46467 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps4bP46467 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps4bP46467 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps4bP46467 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps4bP46467 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps4bP46467 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vps4bP46467 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps4bP46467 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps4bP46467 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps4bP46467 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps4bP46467 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps4bP46467 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps4bP46467 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps4bP46467 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps4bP46467 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps4bP46467 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps4bP46467 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps4bP46467 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps4bP46467 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Vps4bP46467 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps4bP46467 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps4bP46467 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps4bP46467 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps4bP46467 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps4bP46467 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps4bP46467 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps4bP46467 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps4bP46467 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps4bP46467 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps4bP46467 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps4bP46467 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps4bP46467 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps4bP46467 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps4bP46467 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps4bP46467 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps4bP46467 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps4bP46467 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps4bP46467 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps4bP46467 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps4bP46467 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps4bP46467 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps4bP46467 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps4bP46467 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps4bP46467 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms