Protein–RNA interactions for Protein: P42947

YJL107C, Uncharacterized UPF0442 protein YJL107C, yeastyeast

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL107CP42947 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.54□□□□□ -0.4
YJL107CP42947 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.54□□□□□ -0.4
YJL107CP42947 RKM5YLR137W 1104 nt12.51□□□□□ -0.41
YJL107CP42947 YOL037CYOL037C 354 nt12.51□□□□□ -0.41
YJL107CP42947 SDH1YKL148C 1923 nt12.5□□□□□ -0.41
YJL107CP42947 ART5YGR068C 1761 nt12.47□□□□□ -0.41
YJL107CP42947 IRC15YPL017C 1500 nt12.47□□□□□ -0.41
YJL107CP42947 GFD2YCL036W 1701 nt12.42□□□□□ -0.42
YJL107CP42947 GIS3YLR094C 1509 nt12.39□□□□□ -0.43
YJL107CP42947 RTS2YOR077W 699 nt12.39□□□□□ -0.43
YJL107CP42947 SCC4YER147C 1875 nt12.39□□□□□ -0.43
YJL107CP42947 TIR4YOR009W 1464 nt12.33□□□□□ -0.44
YJL107CP42947 PET9YBL030C 957 nt12.29□□□□□ -0.44
YJL107CP42947 YMR057CYMR057C 372 nt12.24□□□□□ -0.45
YJL107CP42947 YCH1YGR203W 447 nt12.18□□□□□ -0.46
YJL107CP42947 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.17□□□□□ -0.46
YJL107CP42947 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.17□□□□□ -0.46
YJL107CP42947 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.17□□□□□ -0.46
YJL107CP42947 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.17□□□□□ -0.46
YJL107CP42947 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.17□□□□□ -0.46
YJL107CP42947 YLR281CYLR281C 468 nt12.17□□□□□ -0.46
YJL107CP42947 YJL152WYJL152W 360 nt12.16□□□□□ -0.46
YJL107CP42947 CUE1YMR264W 612 nt12.16□□□□□ -0.46
YJL107CP42947 YSC84YHR016C 1407 nt12.16□□□□□ -0.46
YJL107CP42947 PCH2YBR186W 1695 nt12.15□□□□□ -0.46
YJL107CP42947 WHI5YOR083W 888 nt12.13□□□□□ -0.47
YJL107CP42947 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.12□□□□□ -0.47
YJL107CP42947 FPS1YLL043W 2010 nt12.1□□□□□ -0.47
YJL107CP42947 PUS2YGL063W 1113 nt12.1□□□□□ -0.47
YJL107CP42947 GUT2YIL155C 1950 nt12.1□□□□□ -0.47
YJL107CP42947 RRT12YCR045C 1476 nt12.09□□□□□ -0.47
YJL107CP42947 YHL050CYHL050C 2094 nt12.09□□□□□ -0.47
YJL107CP42947 SEC11YIR022W 504 nt12.09□□□□□ -0.47
YJL107CP42947 YIL100WYIL100W 354 nt12.02□□□□□ -0.49
YJL107CP42947 PIB2YGL023C 1908 nt11.98□□□□□ -0.49
YJL107CP42947 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.98□□□□□ -0.49
YJL107CP42947 YLR236CYLR236C 324 nt11.96□□□□□ -0.49
YJL107CP42947 YNL195CYNL195C 786 nt11.96□□□□□ -0.49
YJL107CP42947 Q0182Q0182 405 nt11.95□□□□□ -0.5
YJL107CP42947 IMP2'YIL154C 1041 nt11.92□□□□□ -0.5
YJL107CP42947 DSK2YMR276W 1122 nt11.9□□□□□ -0.5
YJL107CP42947 PAC11YDR488C 1602 nt11.86□□□□□ -0.51
YJL107CP42947 RTF1YGL244W 1677 nt11.85□□□□□ -0.51
YJL107CP42947 FMP45YDL222C 930 nt11.79□□□□□ -0.52
YJL107CP42947 IDH1YNL037C 1083 nt11.79□□□□□ -0.52
YJL107CP42947 YPR011CYPR011C 981 nt11.77□□□□□ -0.53
YJL107CP42947 BOP3YNL042W 1191 nt11.76□□□□□ -0.53
YJL107CP42947 GBP2YCL011C 1284 nt11.76□□□□□ -0.53
YJL107CP42947 RRD1YIL153W 1182 nt11.75□□□□□ -0.53
YJL107CP42947 MOT3YMR070W 1473 nt11.74□□□□□ -0.53
YJL107CP42947 PTK1YKL198C 1989 nt11.72□□□□□ -0.53
YJL107CP42947 NCP1YHR042W 2076 nt11.71□□□□□ -0.53
YJL107CP42947 DED1YOR204W 1815 nt11.7□□□□□ -0.54
YJL107CP42947 LCB1YMR296C 1677 nt11.66□□□□□ -0.54
YJL107CP42947 TCD2YKL027W 1344 nt11.64□□□□□ -0.55
YJL107CP42947 YDR433WYDR433W 441 nt11.63□□□□□ -0.55
YJL107CP42947 FMT1YBL013W 1206 nt11.62□□□□□ -0.55
YJL107CP42947 ERV46YAL042W 1248 nt11.61□□□□□ -0.55
YJL107CP42947 MXR2YCL033C 507 nt11.61□□□□□ -0.55
YJL107CP42947 LPX1YOR084W 1164 nt11.6□□□□□ -0.55
YJL107CP42947 PCM1YEL058W 1674 nt11.57□□□□□ -0.56
YJL107CP42947 FMP52YER004W 696 nt11.55□□□□□ -0.56
YJL107CP42947 CWP1YKL096W 720 nt11.54□□□□□ -0.56
YJL107CP42947 YKR040CYKR040C 504 nt11.53□□□□□ -0.56
YJL107CP42947 ADH2YMR303C 1047 nt11.53□□□□□ -0.56
YJL107CP42947 SIM1YIL123W 1431 nt11.52□□□□□ -0.57
YJL107CP42947 YFL054CYFL054C 1941 nt11.5□□□□□ -0.57
YJL107CP42947 NVJ2YPR091C 2313 nt11.47□□□□□ -0.57
YJL107CP42947 SNF6YHL025W 999 nt11.45□□□□□ -0.58
YJL107CP42947 BIO4YNR057C 714 nt11.43□□□□□ -0.58
YJL107CP42947 YCL042WYCL042W 360 nt11.41□□□□□ -0.58
YJL107CP42947 LYS4YDR234W 2082 nt11.4□□□□□ -0.58
YJL107CP42947 SOR2YDL246C 1074 nt11.39□□□□□ -0.59
YJL107CP42947 SOR1YJR159W 1074 nt11.39□□□□□ -0.59
YJL107CP42947 SPP1YPL138C 1062 nt11.39□□□□□ -0.59
YJL107CP42947 SPT8YLR055C 1809 nt11.37□□□□□ -0.59
YJL107CP42947 FRD1YEL047C 1413 nt11.37□□□□□ -0.59
YJL107CP42947 MRPL8YJL063C 717 nt11.34□□□□□ -0.59
YJL107CP42947 YIH1YCR059C 777 nt11.27□□□□□ -0.61
YJL107CP42947 YLL053CYLL053C 459 nt11.27□□□□□ -0.61
YJL107CP42947 ADO1YJR105W 1023 nt11.24□□□□□ -0.61
YJL107CP42947 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.23□□□□□ -0.61
YJL107CP42947 YEL076CYEL076C 651 nt11.23□□□□□ -0.61
YJL107CP42947 YLR464WYLR464W 651 nt11.23□□□□□ -0.61
YJL107CP42947 RNQ1YCL028W 1218 nt11.23□□□□□ -0.61
YJL107CP42947 CRR1YLR213C 1269 nt11.21□□□□□ -0.61
YJL107CP42947 ERF2YLR246W 1080 nt11.21□□□□□ -0.61
YJL107CP42947 RTG1YOL067C 534 nt11.21□□□□□ -0.61
YJL107CP42947 SWE1YJL187C 2460 nt11.2□□□□□ -0.62
YJL107CP42947 ATF2YGR177C 1608 nt11.19□□□□□ -0.62
YJL107CP42947 DIC1YLR348C 897 nt11.18□□□□□ -0.62
YJL107CP42947 MIC10YCL057C-A 294 nt11.18□□□□□ -0.62
YJL107CP42947 PTH1YHR189W 573 nt11.16□□□□□ -0.62
YJL107CP42947 HEM12YDR047W 1089 nt11.13□□□□□ -0.63
YJL107CP42947 FTR1YER145C 1215 nt11.13□□□□□ -0.63
YJL107CP42947 YLR235CYLR235C 399 nt11.13□□□□□ -0.63
YJL107CP42947 TRM5YHR070W 1500 nt11.13□□□□□ -0.63
YJL107CP42947 GAL1YBR020W 1587 nt11.11□□□□□ -0.63
YJL107CP42947 SNG1YGR197C 1644 nt11.1□□□□□ -0.63
YJL107CP42947 HUA1YGR268C 597 nt11.09□□□□□ -0.63
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