Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIA3P42263 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA3P42263 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA3P42263 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA3P42263 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIA3P42263 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIA3P42263 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIA3P42263 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIA3P42263 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIA3P42263 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIA3P42263 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIA3P42263 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIA3P42263 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIA3P42263 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIA3P42263 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIA3P42263 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIA3P42263 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIA3P42263 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIA3P42263 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIA3P42263 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIA3P42263 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIA3P42263 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIA3P42263 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIA3P42263 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIA3P42263 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIA3P42263 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIA3P42263 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GRIA3P42263 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIA3P42263 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIA3P42263 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIA3P42263 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIA3P42263 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIA3P42263 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIA3P42263 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIA3P42263 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIA3P42263 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIA3P42263 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIA3P42263 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIA3P42263 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIA3P42263 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIA3P42263 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIA3P42263 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIA3P42263 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIA3P42263 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIA3P42263 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIA3P42263 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIA3P42263 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIA3P42263 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIA3P42263 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIA3P42263 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIA3P42263 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIA3P42263 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIA3P42263 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIA3P42263 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIA3P42263 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIA3P42263 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIA3P42263 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIA3P42263 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIA3P42263 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIA3P42263 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIA3P42263 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIA3P42263 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIA3P42263 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIA3P42263 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIA3P42263 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIA3P42263 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIA3P42263 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIA3P42263 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIA3P42263 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIA3P42263 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIA3P42263 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIA3P42263 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIA3P42263 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIA3P42263 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIA3P42263 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIA3P42263 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIA3P42263 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIA3P42263 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIA3P42263 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIA3P42263 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIA3P42263 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GRIA3P42263 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIA3P42263 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIA3P42263 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIA3P42263 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIA3P42263 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIA3P42263 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms