Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNFP41002 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNFP41002 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNFP41002 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNFP41002 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNFP41002 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNFP41002 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNFP41002 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNFP41002 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNFP41002 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNFP41002 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNFP41002 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNFP41002 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNFP41002 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNFP41002 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNFP41002 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNFP41002 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNFP41002 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNFP41002 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNFP41002 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNFP41002 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNFP41002 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNFP41002 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNFP41002 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNFP41002 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNFP41002 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNFP41002 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNFP41002 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCNFP41002 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNFP41002 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNFP41002 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNFP41002 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNFP41002 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNFP41002 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNFP41002 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNFP41002 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNFP41002 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNFP41002 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNFP41002 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNFP41002 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNFP41002 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNFP41002 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNFP41002 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNFP41002 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNFP41002 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNFP41002 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNFP41002 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCNFP41002 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNFP41002 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNFP41002 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNFP41002 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNFP41002 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNFP41002 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNFP41002 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNFP41002 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNFP41002 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNFP41002 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNFP41002 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNFP41002 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNFP41002 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNFP41002 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNFP41002 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNFP41002 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNFP41002 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNFP41002 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNFP41002 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNFP41002 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNFP41002 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNFP41002 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNFP41002 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNFP41002 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNFP41002 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNFP41002 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCNFP41002 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNFP41002 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNFP41002 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNFP41002 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNFP41002 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNFP41002 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNFP41002 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNFP41002 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNFP41002 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNFP41002 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNFP41002 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNFP41002 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNFP41002 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNFP41002 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNFP41002 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNFP41002 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNFP41002 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNFP41002 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNFP41002 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNFP41002 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNFP41002 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNFP41002 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNFP41002 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNFP41002 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNFP41002 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNFP41002 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNFP41002 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms