Protein–RNA interactions for Protein: P40048

PTP3, Tyrosine-protein phosphatase 3, yeastyeast

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Length 928 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP3P40048 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt16.66■□□□□ 0.26
PTP3P40048 YBL100CYBL100C 315 nt16.66■□□□□ 0.26
PTP3P40048 LPX1YOR084W 1164 nt16.64■□□□□ 0.25
PTP3P40048 POA1YBR022W 534 nt16.63■□□□□ 0.25
PTP3P40048 RTG1YOL067C 534 nt16.62■□□□□ 0.25
PTP3P40048 INM2YDR287W 879 nt16.61■□□□□ 0.25
PTP3P40048 TRM9YML014W 840 nt16.61■□□□□ 0.25
PTP3P40048 FPR4YLR449W 1179 nt16.59■□□□□ 0.25
PTP3P40048 SIS1YNL007C 1059 nt16.55■□□□□ 0.24
PTP3P40048 BUD23YCR047C 828 nt16.53■□□□□ 0.24
PTP3P40048 NAB2YGL122C 1578 nt16.49■□□□□ 0.23
PTP3P40048 FUN26YAL022C 1554 nt16.49■□□□□ 0.23
PTP3P40048 ARO7YPR060C 771 nt16.47■□□□□ 0.23
PTP3P40048 DAL1YIR027C 1383 nt16.47■□□□□ 0.23
PTP3P40048 ERV46YAL042W 1248 nt16.46■□□□□ 0.23
PTP3P40048 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt16.41■□□□□ 0.22
PTP3P40048 YJL152WYJL152W 360 nt16.4■□□□□ 0.22
PTP3P40048 FIS1YIL065C 468 nt16.38■□□□□ 0.21
PTP3P40048 YDR094WYDR094W 336 nt16.37■□□□□ 0.21
PTP3P40048 YDR433WYDR433W 441 nt16.36■□□□□ 0.21
PTP3P40048 CCT6YDR188W 1641 nt16.34■□□□□ 0.21
PTP3P40048 PHO4YFR034C 939 nt16.33■□□□□ 0.2
PTP3P40048 IDH1YNL037C 1083 nt16.31■□□□□ 0.2
PTP3P40048 HUA1YGR268C 597 nt16.29■□□□□ 0.2
PTP3P40048 YKR040CYKR040C 504 nt16.26■□□□□ 0.19
PTP3P40048 PAM17YKR065C 594 nt16.24■□□□□ 0.19
PTP3P40048 VAR1Q0140 1197 nt16.17■□□□□ 0.18
PTP3P40048 MXR2YCL033C 507 nt16.17■□□□□ 0.18
PTP3P40048 SUF2tP(AGG)C 72 nt16.13■□□□□ 0.17
PTP3P40048 SUF10tP(AGG)N 72 nt16.13■□□□□ 0.17
PTP3P40048 REG2YBR050C 1017 nt16.13■□□□□ 0.17
PTP3P40048 SBA1YKL117W 651 nt16.11■□□□□ 0.17
PTP3P40048 ALF1YNL148C 765 nt16.09■□□□□ 0.17
PTP3P40048 GBP2YCL011C 1284 nt16.09■□□□□ 0.17
PTP3P40048 YDR509WYDR509W 348 nt16.04■□□□□ 0.16
PTP3P40048 YPS1YLR120C 1710 nt15.92■□□□□ 0.14
PTP3P40048 TIR4YOR009W 1464 nt15.88■□□□□ 0.13
PTP3P40048 PTH1YHR189W 573 nt15.8■□□□□ 0.12
PTP3P40048 BUR6YER159C 429 nt15.79■□□□□ 0.12
PTP3P40048 BMT5YIL096C 1011 nt15.78■□□□□ 0.12
PTP3P40048 PAU16YKL224C 372 nt15.78■□□□□ 0.12
PTP3P40048 TCD2YKL027W 1344 nt15.74■□□□□ 0.11
PTP3P40048 FRD1YEL047C 1413 nt15.71■□□□□ 0.11
PTP3P40048 YDR095CYDR095C 411 nt15.71■□□□□ 0.11
PTP3P40048 YKL030WYKL030W 606 nt15.7■□□□□ 0.1
PTP3P40048 CAC2YML102W 1407 nt15.68■□□□□ 0.1
PTP3P40048 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.68■□□□□ 0.1
PTP3P40048 MET8YBR213W 825 nt15.67■□□□□ 0.1
PTP3P40048 YMR057CYMR057C 372 nt15.64■□□□□ 0.09
PTP3P40048 Q0010Q0010 387 nt15.59■□□□□ 0.09
PTP3P40048 LCB1YMR296C 1677 nt15.58■□□□□ 0.08
PTP3P40048 YLR235CYLR235C 399 nt15.58■□□□□ 0.08
PTP3P40048 RRT5YFR032C 870 nt15.55■□□□□ 0.08
PTP3P40048 CLB6YGR109C 1143 nt15.55■□□□□ 0.08
PTP3P40048 Q0144Q0144 330 nt15.55■□□□□ 0.08
PTP3P40048 DED1YOR204W 1815 nt15.54■□□□□ 0.08
PTP3P40048 PRE6YOL038W 765 nt15.54■□□□□ 0.08
PTP3P40048 ART5YGR068C 1761 nt15.53■□□□□ 0.08
PTP3P40048 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.51■□□□□ 0.07
PTP3P40048 YFR018CYFR018C 1092 nt15.5■□□□□ 0.07
PTP3P40048 YCL042WYCL042W 360 nt15.48■□□□□ 0.07
PTP3P40048 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt15.46■□□□□ 0.07
PTP3P40048 RRD1YIL153W 1182 nt15.44■□□□□ 0.06
PTP3P40048 RPP2AYOL039W 321 nt15.44■□□□□ 0.06
PTP3P40048 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt15.43■□□□□ 0.06
PTP3P40048 SEM1YDR363W-A 270 nt15.42■□□□□ 0.06
PTP3P40048 PET9YBL030C 957 nt15.42■□□□□ 0.06
PTP3P40048 SRN2YLR119W 642 nt15.41■□□□□ 0.06
PTP3P40048 SNF6YHL025W 999 nt15.4■□□□□ 0.06
PTP3P40048 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt15.35■□□□□ 0.05
PTP3P40048 FMT1YBL013W 1206 nt15.35■□□□□ 0.05
PTP3P40048 GFD2YCL036W 1701 nt15.34■□□□□ 0.05
PTP3P40048 ARA2YMR041C 1008 nt15.33■□□□□ 0.04
PTP3P40048 SOR2YDL246C 1074 nt15.31■□□□□ 0.04
PTP3P40048 SOR1YJR159W 1074 nt15.31■□□□□ 0.04
PTP3P40048 PTP1YDL230W 1008 nt15.28■□□□□ 0.04
PTP3P40048 YLR122CYLR122C 378 nt15.25■□□□□ 0.03
PTP3P40048 DIC1YLR348C 897 nt15.24■□□□□ 0.03
PTP3P40048 FPS1YLL043W 2010 nt15.21■□□□□ 0.03
PTP3P40048 TIM23YNR017W 669 nt15.2■□□□□ 0.02
PTP3P40048 CWP1YKL096W 720 nt15.15■□□□□ 0.02
PTP3P40048 NAT4YMR069W 858 nt15.15■□□□□ 0.02
PTP3P40048 YFL066CYFL066C 1179 nt15.14■□□□□ 0.01
PTP3P40048 RTS2YOR077W 699 nt15.14■□□□□ 0.01
PTP3P40048 YLR179CYLR179C 606 nt15.1■□□□□ 0.01
PTP3P40048 YPR064WYPR064W 420 nt15.06■□□□□ 0
PTP3P40048 ADH2YMR303C 1047 nt15.05■□□□□ -0
PTP3P40048 YMR244WYMR244W 1068 nt15.01□□□□□ -0.01
PTP3P40048 ARP10YDR106W 855 nt15□□□□□ -0.01
PTP3P40048 TAD3YLR316C 969 nt15□□□□□ -0.01
PTP3P40048 GLK1YCL040W 1503 nt15□□□□□ -0.01
PTP3P40048 LCP5YER127W 1074 nt14.99□□□□□ -0.01
PTP3P40048 FMP52YER004W 696 nt14.96□□□□□ -0.01
PTP3P40048 PEX25YPL112C 1185 nt14.95□□□□□ -0.02
PTP3P40048 MEP2YNL142W 1500 nt14.93□□□□□ -0.02
PTP3P40048 TOM20YGR082W 552 nt14.93□□□□□ -0.02
PTP3P40048 MSF1YPR047W 1410 nt14.92□□□□□ -0.02
PTP3P40048 URH1YDR400W 1023 nt14.91□□□□□ -0.02
PTP3P40048 ABZ2YMR289W 1125 nt14.91□□□□□ -0.02
PTP3P40048 WSC2YNL283C 1512 nt14.9□□□□□ -0.02
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