Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fen1P39749 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fen1P39749 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fen1P39749 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fen1P39749 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fen1P39749 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Fen1P39749 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fen1P39749 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fen1P39749 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fen1P39749 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fen1P39749 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fen1P39749 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fen1P39749 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fen1P39749 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fen1P39749 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fen1P39749 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fen1P39749 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Fen1P39749 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fen1P39749 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fen1P39749 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fen1P39749 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fen1P39749 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fen1P39749 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fen1P39749 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fen1P39749 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Fen1P39749 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fen1P39749 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fen1P39749 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fen1P39749 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fen1P39749 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fen1P39749 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fen1P39749 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fen1P39749 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fen1P39749 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fen1P39749 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fen1P39749 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fen1P39749 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fen1P39749 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fen1P39749 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fen1P39749 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fen1P39749 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fen1P39749 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fen1P39749 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Fen1P39749 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fen1P39749 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Fen1P39749 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fen1P39749 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fen1P39749 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fen1P39749 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fen1P39749 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fen1P39749 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fen1P39749 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fen1P39749 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fen1P39749 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Fen1P39749 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fen1P39749 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fen1P39749 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fen1P39749 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fen1P39749 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fen1P39749 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fen1P39749 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fen1P39749 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fen1P39749 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Fen1P39749 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fen1P39749 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fen1P39749 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fen1P39749 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fen1P39749 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fen1P39749 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fen1P39749 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fen1P39749 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fen1P39749 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fen1P39749 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fen1P39749 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fen1P39749 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fen1P39749 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fen1P39749 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Fen1P39749 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fen1P39749 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fen1P39749 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fen1P39749 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fen1P39749 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fen1P39749 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fen1P39749 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fen1P39749 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fen1P39749 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Fen1P39749 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fen1P39749 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fen1P39749 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fen1P39749 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Fen1P39749 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fen1P39749 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fen1P39749 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fen1P39749 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fen1P39749 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fen1P39749 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fen1P39749 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fen1P39749 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fen1P39749 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fen1P39749 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms