Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA7P36544 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA7P36544 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA7P36544 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA7P36544 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA7P36544 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA7P36544 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA7P36544 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA7P36544 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA7P36544 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA7P36544 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA7P36544 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA7P36544 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA7P36544 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA7P36544 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA7P36544 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA7P36544 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA7P36544 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA7P36544 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA7P36544 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA7P36544 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA7P36544 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA7P36544 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA7P36544 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA7P36544 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA7P36544 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA7P36544 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA7P36544 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA7P36544 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA7P36544 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA7P36544 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA7P36544 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA7P36544 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA7P36544 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA7P36544 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA7P36544 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA7P36544 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA7P36544 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA7P36544 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA7P36544 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA7P36544 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA7P36544 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA7P36544 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA7P36544 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA7P36544 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA7P36544 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA7P36544 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA7P36544 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA7P36544 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA7P36544 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA7P36544 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA7P36544 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA7P36544 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA7P36544 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA7P36544 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA7P36544 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA7P36544 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA7P36544 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA7P36544 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA7P36544 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA7P36544 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA7P36544 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA7P36544 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA7P36544 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA7P36544 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA7P36544 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA7P36544 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA7P36544 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA7P36544 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA7P36544 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA7P36544 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA7P36544 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA7P36544 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms