Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT20P35900 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT20P35900 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT20P35900 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT20P35900 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT20P35900 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT20P35900 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT20P35900 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT20P35900 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT20P35900 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT20P35900 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT20P35900 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT20P35900 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT20P35900 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT20P35900 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT20P35900 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT20P35900 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT20P35900 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT20P35900 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT20P35900 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT20P35900 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT20P35900 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT20P35900 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT20P35900 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT20P35900 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT20P35900 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT20P35900 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT20P35900 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT20P35900 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT20P35900 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT20P35900 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT20P35900 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT20P35900 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT20P35900 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT20P35900 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT20P35900 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT20P35900 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT20P35900 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT20P35900 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT20P35900 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT20P35900 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT20P35900 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT20P35900 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT20P35900 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT20P35900 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT20P35900 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT20P35900 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT20P35900 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT20P35900 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT20P35900 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT20P35900 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT20P35900 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT20P35900 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT20P35900 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT20P35900 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT20P35900 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT20P35900 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT20P35900 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT20P35900 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT20P35900 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT20P35900 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT20P35900 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT20P35900 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT20P35900 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT20P35900 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT20P35900 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT20P35900 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT20P35900 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT20P35900 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT20P35900 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT20P35900 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT20P35900 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT20P35900 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT20P35900 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT20P35900 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT20P35900 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT20P35900 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT20P35900 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT20P35900 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT20P35900 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT20P35900 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT20P35900 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT20P35900 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT20P35900 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT20P35900 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT20P35900 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT20P35900 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT20P35900 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT20P35900 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT20P35900 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT20P35900 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT20P35900 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT20P35900 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT20P35900 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT20P35900 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT20P35900 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT20P35900 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT20P35900 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT20P35900 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT20P35900 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms