Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX6P35712 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX6P35712 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX6P35712 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX6P35712 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX6P35712 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX6P35712 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX6P35712 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX6P35712 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX6P35712 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX6P35712 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX6P35712 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX6P35712 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX6P35712 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX6P35712 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX6P35712 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX6P35712 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX6P35712 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX6P35712 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX6P35712 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX6P35712 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX6P35712 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX6P35712 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX6P35712 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOX6P35712 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX6P35712 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX6P35712 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX6P35712 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX6P35712 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX6P35712 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX6P35712 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX6P35712 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX6P35712 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX6P35712 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX6P35712 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX6P35712 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX6P35712 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX6P35712 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX6P35712 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX6P35712 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX6P35712 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX6P35712 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX6P35712 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX6P35712 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX6P35712 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX6P35712 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX6P35712 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX6P35712 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX6P35712 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX6P35712 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX6P35712 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX6P35712 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX6P35712 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX6P35712 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX6P35712 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX6P35712 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX6P35712 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SOX6P35712 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX6P35712 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX6P35712 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX6P35712 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX6P35712 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX6P35712 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX6P35712 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX6P35712 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX6P35712 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX6P35712 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX6P35712 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX6P35712 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX6P35712 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX6P35712 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX6P35712 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX6P35712 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX6P35712 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOX6P35712 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX6P35712 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX6P35712 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX6P35712 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX6P35712 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX6P35712 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX6P35712 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX6P35712 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOX6P35712 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOX6P35712 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX6P35712 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX6P35712 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX6P35712 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX6P35712 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX6P35712 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX6P35712 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX6P35712 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX6P35712 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX6P35712 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX6P35712 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX6P35712 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX6P35712 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX6P35712 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX6P35712 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX6P35712 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX6P35712 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms