Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HNF1BP35680 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HNF1BP35680 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HNF1BP35680 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HNF1BP35680 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HNF1BP35680 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HNF1BP35680 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HNF1BP35680 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HNF1BP35680 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HNF1BP35680 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HNF1BP35680 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HNF1BP35680 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HNF1BP35680 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HNF1BP35680 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HNF1BP35680 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HNF1BP35680 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HNF1BP35680 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HNF1BP35680 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HNF1BP35680 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HNF1BP35680 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HNF1BP35680 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HNF1BP35680 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HNF1BP35680 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HNF1BP35680 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HNF1BP35680 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HNF1BP35680 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HNF1BP35680 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HNF1BP35680 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HNF1BP35680 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HNF1BP35680 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HNF1BP35680 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HNF1BP35680 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HNF1BP35680 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HNF1BP35680 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HNF1BP35680 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNF1BP35680 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HNF1BP35680 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HNF1BP35680 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HNF1BP35680 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HNF1BP35680 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HNF1BP35680 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HNF1BP35680 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HNF1BP35680 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HNF1BP35680 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HNF1BP35680 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HNF1BP35680 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HNF1BP35680 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HNF1BP35680 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HNF1BP35680 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HNF1BP35680 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HNF1BP35680 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HNF1BP35680 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HNF1BP35680 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HNF1BP35680 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HNF1BP35680 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HNF1BP35680 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HNF1BP35680 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HNF1BP35680 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HNF1BP35680 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HNF1BP35680 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HNF1BP35680 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HNF1BP35680 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HNF1BP35680 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HNF1BP35680 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HNF1BP35680 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HNF1BP35680 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HNF1BP35680 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HNF1BP35680 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HNF1BP35680 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNF1BP35680 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNF1BP35680 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNF1BP35680 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNF1BP35680 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HNF1BP35680 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HNF1BP35680 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HNF1BP35680 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HNF1BP35680 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HNF1BP35680 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HNF1BP35680 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HNF1BP35680 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HNF1BP35680 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HNF1BP35680 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HNF1BP35680 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HNF1BP35680 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HNF1BP35680 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HNF1BP35680 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HNF1BP35680 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HNF1BP35680 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HNF1BP35680 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HNF1BP35680 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HNF1BP35680 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HNF1BP35680 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HNF1BP35680 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HNF1BP35680 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HNF1BP35680 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HNF1BP35680 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HNF1BP35680 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HNF1BP35680 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HNF1BP35680 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HNF1BP35680 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms