Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRA5P31644 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRA5P31644 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRA5P31644 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRA5P31644 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRA5P31644 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRA5P31644 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRA5P31644 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRA5P31644 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRA5P31644 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRA5P31644 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRA5P31644 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRA5P31644 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRA5P31644 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GABRA5P31644 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRA5P31644 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRA5P31644 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRA5P31644 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRA5P31644 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRA5P31644 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRA5P31644 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRA5P31644 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRA5P31644 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRA5P31644 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRA5P31644 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRA5P31644 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRA5P31644 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRA5P31644 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRA5P31644 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRA5P31644 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRA5P31644 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRA5P31644 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRA5P31644 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRA5P31644 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRA5P31644 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRA5P31644 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRA5P31644 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRA5P31644 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRA5P31644 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA5P31644 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA5P31644 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRA5P31644 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRA5P31644 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABRA5P31644 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRA5P31644 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRA5P31644 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRA5P31644 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRA5P31644 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRA5P31644 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRA5P31644 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRA5P31644 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRA5P31644 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRA5P31644 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRA5P31644 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRA5P31644 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRA5P31644 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRA5P31644 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRA5P31644 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRA5P31644 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRA5P31644 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRA5P31644 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRA5P31644 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRA5P31644 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRA5P31644 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRA5P31644 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRA5P31644 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRA5P31644 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRA5P31644 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRA5P31644 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA5P31644 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA5P31644 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA5P31644 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRA5P31644 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRA5P31644 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRA5P31644 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRA5P31644 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRA5P31644 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRA5P31644 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRA5P31644 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRA5P31644 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRA5P31644 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRA5P31644 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRA5P31644 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA5P31644 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA5P31644 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA5P31644 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRA5P31644 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABRA5P31644 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRA5P31644 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA5P31644 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA5P31644 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA5P31644 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRA5P31644 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRA5P31644 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABRA5P31644 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRA5P31644 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRA5P31644 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRA5P31644 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRA5P31644 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRA5P31644 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms