Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXC12P31275 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXC12P31275 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXC12P31275 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC12P31275 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC12P31275 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC12P31275 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC12P31275 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC12P31275 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC12P31275 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC12P31275 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC12P31275 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC12P31275 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC12P31275 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC12P31275 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC12P31275 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC12P31275 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC12P31275 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC12P31275 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC12P31275 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC12P31275 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC12P31275 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC12P31275 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC12P31275 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC12P31275 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC12P31275 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXC12P31275 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC12P31275 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC12P31275 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC12P31275 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC12P31275 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC12P31275 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC12P31275 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC12P31275 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC12P31275 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC12P31275 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC12P31275 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC12P31275 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC12P31275 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC12P31275 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC12P31275 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC12P31275 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC12P31275 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC12P31275 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC12P31275 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC12P31275 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC12P31275 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC12P31275 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC12P31275 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC12P31275 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC12P31275 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC12P31275 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC12P31275 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC12P31275 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC12P31275 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC12P31275 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXC12P31275 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC12P31275 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC12P31275 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC12P31275 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC12P31275 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC12P31275 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC12P31275 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC12P31275 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC12P31275 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC12P31275 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC12P31275 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC12P31275 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC12P31275 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC12P31275 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC12P31275 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC12P31275 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC12P31275 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC12P31275 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC12P31275 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC12P31275 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC12P31275 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC12P31275 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC12P31275 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC12P31275 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC12P31275 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC12P31275 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC12P31275 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC12P31275 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC12P31275 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC12P31275 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC12P31275 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC12P31275 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC12P31275 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC12P31275 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC12P31275 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC12P31275 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC12P31275 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC12P31275 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC12P31275 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC12P31275 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC12P31275 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC12P31275 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC12P31275 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC12P31275 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms