Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Hoxc10P31257 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Hoxc10P31257 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Hoxc10P31257 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hoxc10P31257 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hoxc10P31257 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hoxc10P31257 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hoxc10P31257 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hoxc10P31257 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Hoxc10P31257 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Hoxc10P31257 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hoxc10P31257 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Hoxc10P31257 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hoxc10P31257 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Hoxc10P31257 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Hoxc10P31257 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Hoxc10P31257 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Hoxc10P31257 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Hoxc10P31257 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Hoxc10P31257 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Hoxc10P31257 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Hoxc10P31257 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Hoxc10P31257 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Hoxc10P31257 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Hoxc10P31257 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Hoxc10P31257 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hoxc10P31257 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hoxc10P31257 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hoxc10P31257 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Hoxc10P31257 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Hoxc10P31257 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Hoxc10P31257 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hoxc10P31257 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Hoxc10P31257 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Hoxc10P31257 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Hoxc10P31257 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hoxc10P31257 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Hoxc10P31257 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hoxc10P31257 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Hoxc10P31257 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Hoxc10P31257 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hoxc10P31257 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hoxc10P31257 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hoxc10P31257 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hoxc10P31257 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hoxc10P31257 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Hoxc10P31257 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hoxc10P31257 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Hoxc10P31257 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Hoxc10P31257 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Hoxc10P31257 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Hoxc10P31257 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Hoxc10P31257 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Hoxc10P31257 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Hoxc10P31257 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Hoxc10P31257 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hoxc10P31257 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hoxc10P31257 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hoxc10P31257 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Hoxc10P31257 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Hoxc10P31257 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Hoxc10P31257 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Hoxc10P31257 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Hoxc10P31257 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Hoxc10P31257 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Hoxc10P31257 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hoxc10P31257 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Hoxc10P31257 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Hoxc10P31257 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Hoxc10P31257 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hoxc10P31257 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hoxc10P31257 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hoxc10P31257 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Hoxc10P31257 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Hoxc10P31257 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hoxc10P31257 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxc10P31257 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxc10P31257 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hoxc10P31257 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hoxc10P31257 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Hoxc10P31257 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Hoxc10P31257 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Hoxc10P31257 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hoxc10P31257 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Hoxc10P31257 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Hoxc10P31257 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Hoxc10P31257 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Hoxc10P31257 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Hoxc10P31257 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hoxc10P31257 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hoxc10P31257 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Hoxc10P31257 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Hoxc10P31257 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Hoxc10P31257 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Hoxc10P31257 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Hoxc10P31257 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Hoxc10P31257 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Hoxc10P31257 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Hoxc10P31257 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hoxc10P31257 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms