Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Casp1P29452 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Casp1P29452 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Casp1P29452 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Casp1P29452 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Casp1P29452 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Casp1P29452 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Casp1P29452 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Casp1P29452 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Casp1P29452 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Casp1P29452 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Casp1P29452 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Casp1P29452 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Casp1P29452 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Casp1P29452 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Casp1P29452 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Casp1P29452 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Casp1P29452 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Casp1P29452 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Casp1P29452 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Casp1P29452 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Casp1P29452 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Casp1P29452 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Casp1P29452 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Casp1P29452 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Casp1P29452 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Casp1P29452 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Casp1P29452 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Casp1P29452 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Casp1P29452 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Casp1P29452 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Casp1P29452 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Casp1P29452 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Casp1P29452 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Casp1P29452 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Casp1P29452 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Casp1P29452 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Casp1P29452 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Casp1P29452 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Casp1P29452 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Casp1P29452 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Casp1P29452 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Casp1P29452 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Casp1P29452 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Casp1P29452 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Casp1P29452 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Casp1P29452 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Casp1P29452 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Casp1P29452 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Casp1P29452 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Casp1P29452 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Casp1P29452 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Casp1P29452 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Casp1P29452 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Casp1P29452 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Casp1P29452 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Casp1P29452 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Casp1P29452 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Casp1P29452 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Casp1P29452 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Casp1P29452 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Casp1P29452 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Casp1P29452 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Casp1P29452 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Casp1P29452 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Casp1P29452 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Casp1P29452 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Casp1P29452 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Casp1P29452 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Casp1P29452 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Casp1P29452 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Casp1P29452 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Casp1P29452 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Casp1P29452 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Casp1P29452 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Casp1P29452 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Casp1P29452 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Casp1P29452 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Casp1P29452 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Casp1P29452 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Casp1P29452 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Casp1P29452 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Casp1P29452 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Casp1P29452 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Casp1P29452 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Casp1P29452 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Casp1P29452 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Casp1P29452 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Casp1P29452 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Casp1P29452 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Casp1P29452 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Casp1P29452 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Casp1P29452 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Casp1P29452 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Casp1P29452 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Casp1P29452 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Casp1P29452 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Casp1P29452 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Casp1P29452 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Casp1P29452 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms