Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHA2P29317 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHA2P29317 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHA2P29317 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHA2P29317 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHA2P29317 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHA2P29317 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHA2P29317 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHA2P29317 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHA2P29317 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHA2P29317 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EPHA2P29317 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHA2P29317 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHA2P29317 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHA2P29317 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHA2P29317 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHA2P29317 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHA2P29317 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHA2P29317 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EPHA2P29317 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPHA2P29317 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHA2P29317 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHA2P29317 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHA2P29317 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHA2P29317 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHA2P29317 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPHA2P29317 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPHA2P29317 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHA2P29317 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHA2P29317 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHA2P29317 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPHA2P29317 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EPHA2P29317 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHA2P29317 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHA2P29317 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHA2P29317 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHA2P29317 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHA2P29317 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHA2P29317 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHA2P29317 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHA2P29317 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHA2P29317 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHA2P29317 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHA2P29317 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHA2P29317 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHA2P29317 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHA2P29317 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHA2P29317 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHA2P29317 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHA2P29317 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHA2P29317 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHA2P29317 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHA2P29317 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHA2P29317 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHA2P29317 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHA2P29317 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHA2P29317 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHA2P29317 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHA2P29317 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHA2P29317 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHA2P29317 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHA2P29317 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHA2P29317 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHA2P29317 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHA2P29317 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHA2P29317 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHA2P29317 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHA2P29317 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHA2P29317 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHA2P29317 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHA2P29317 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHA2P29317 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHA2P29317 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHA2P29317 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHA2P29317 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHA2P29317 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHA2P29317 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHA2P29317 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHA2P29317 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHA2P29317 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHA2P29317 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPHA2P29317 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHA2P29317 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHA2P29317 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EPHA2P29317 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPHA2P29317 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPHA2P29317 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHA2P29317 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHA2P29317 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHA2P29317 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHA2P29317 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHA2P29317 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPHA2P29317 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPHA2P29317 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHA2P29317 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHA2P29317 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHA2P29317 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHA2P29317 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHA2P29317 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHA2P29317 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms