Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD34P28906 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD34P28906 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD34P28906 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD34P28906 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD34P28906 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD34P28906 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD34P28906 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD34P28906 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD34P28906 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD34P28906 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD34P28906 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD34P28906 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD34P28906 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CD34P28906 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD34P28906 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD34P28906 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD34P28906 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD34P28906 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD34P28906 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD34P28906 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD34P28906 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD34P28906 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD34P28906 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD34P28906 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD34P28906 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD34P28906 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD34P28906 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD34P28906 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD34P28906 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD34P28906 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD34P28906 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD34P28906 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD34P28906 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD34P28906 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD34P28906 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD34P28906 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD34P28906 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD34P28906 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD34P28906 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD34P28906 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD34P28906 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD34P28906 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD34P28906 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD34P28906 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD34P28906 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD34P28906 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD34P28906 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD34P28906 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD34P28906 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD34P28906 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD34P28906 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD34P28906 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD34P28906 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD34P28906 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD34P28906 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD34P28906 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD34P28906 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CD34P28906 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD34P28906 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD34P28906 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD34P28906 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD34P28906 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD34P28906 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD34P28906 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD34P28906 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD34P28906 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD34P28906 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD34P28906 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD34P28906 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD34P28906 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD34P28906 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD34P28906 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD34P28906 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD34P28906 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD34P28906 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD34P28906 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD34P28906 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CD34P28906 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD34P28906 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD34P28906 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD34P28906 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD34P28906 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD34P28906 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD34P28906 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD34P28906 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD34P28906 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD34P28906 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD34P28906 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD34P28906 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD34P28906 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD34P28906 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD34P28906 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD34P28906 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD34P28906 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD34P28906 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD34P28906 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD34P28906 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD34P28906 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD34P28906 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms