Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMA1P25391 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMA1P25391 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMA1P25391 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMA1P25391 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMA1P25391 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMA1P25391 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMA1P25391 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMA1P25391 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMA1P25391 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMA1P25391 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMA1P25391 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMA1P25391 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMA1P25391 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA1P25391 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA1P25391 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMA1P25391 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMA1P25391 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMA1P25391 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMA1P25391 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMA1P25391 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMA1P25391 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMA1P25391 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMA1P25391 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMA1P25391 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMA1P25391 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMA1P25391 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMA1P25391 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMA1P25391 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMA1P25391 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMA1P25391 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMA1P25391 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMA1P25391 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMA1P25391 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMA1P25391 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMA1P25391 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMA1P25391 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMA1P25391 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMA1P25391 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMA1P25391 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMA1P25391 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA1P25391 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMA1P25391 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMA1P25391 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMA1P25391 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA1P25391 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMA1P25391 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMA1P25391 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA1P25391 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA1P25391 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMA1P25391 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA1P25391 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMA1P25391 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA1P25391 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA1P25391 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA1P25391 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMA1P25391 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMA1P25391 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMA1P25391 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA1P25391 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA1P25391 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMA1P25391 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMA1P25391 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA1P25391 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA1P25391 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA1P25391 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA1P25391 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA1P25391 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMA1P25391 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA1P25391 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA1P25391 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA1P25391 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMA1P25391 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMA1P25391 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA1P25391 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA1P25391 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA1P25391 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA1P25391 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA1P25391 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA1P25391 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA1P25391 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA1P25391 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMA1P25391 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA1P25391 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMA1P25391 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMA1P25391 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMA1P25391 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMA1P25391 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA1P25391 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA1P25391 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA1P25391 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA1P25391 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA1P25391 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA1P25391 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA1P25391 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA1P25391 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA1P25391 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA1P25391 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA1P25391 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA1P25391 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms