Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NdnP25233 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NdnP25233 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NdnP25233 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NdnP25233 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NdnP25233 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NdnP25233 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NdnP25233 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NdnP25233 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NdnP25233 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NdnP25233 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NdnP25233 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NdnP25233 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NdnP25233 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NdnP25233 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NdnP25233 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NdnP25233 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NdnP25233 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NdnP25233 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NdnP25233 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NdnP25233 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NdnP25233 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NdnP25233 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NdnP25233 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NdnP25233 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
NdnP25233 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NdnP25233 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NdnP25233 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NdnP25233 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NdnP25233 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NdnP25233 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NdnP25233 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NdnP25233 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NdnP25233 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NdnP25233 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NdnP25233 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NdnP25233 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NdnP25233 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NdnP25233 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NdnP25233 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NdnP25233 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NdnP25233 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NdnP25233 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NdnP25233 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NdnP25233 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NdnP25233 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NdnP25233 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NdnP25233 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NdnP25233 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NdnP25233 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NdnP25233 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NdnP25233 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NdnP25233 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NdnP25233 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NdnP25233 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NdnP25233 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NdnP25233 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NdnP25233 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NdnP25233 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NdnP25233 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NdnP25233 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NdnP25233 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NdnP25233 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NdnP25233 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NdnP25233 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NdnP25233 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NdnP25233 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NdnP25233 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NdnP25233 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NdnP25233 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NdnP25233 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NdnP25233 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NdnP25233 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NdnP25233 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NdnP25233 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NdnP25233 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NdnP25233 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NdnP25233 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NdnP25233 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NdnP25233 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NdnP25233 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NdnP25233 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NdnP25233 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NdnP25233 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NdnP25233 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NdnP25233 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NdnP25233 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NdnP25233 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NdnP25233 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NdnP25233 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NdnP25233 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NdnP25233 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NdnP25233 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NdnP25233 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NdnP25233 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NdnP25233 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NdnP25233 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NdnP25233 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NdnP25233 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NdnP25233 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms