Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL8A2P25067 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL8A2P25067 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL8A2P25067 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL8A2P25067 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL8A2P25067 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL8A2P25067 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL8A2P25067 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL8A2P25067 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL8A2P25067 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL8A2P25067 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL8A2P25067 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL8A2P25067 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL8A2P25067 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL8A2P25067 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL8A2P25067 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL8A2P25067 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL8A2P25067 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL8A2P25067 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL8A2P25067 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL8A2P25067 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL8A2P25067 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL8A2P25067 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL8A2P25067 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL8A2P25067 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL8A2P25067 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL8A2P25067 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL8A2P25067 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL8A2P25067 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
COL8A2P25067 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL8A2P25067 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL8A2P25067 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL8A2P25067 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL8A2P25067 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL8A2P25067 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL8A2P25067 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL8A2P25067 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL8A2P25067 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL8A2P25067 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL8A2P25067 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL8A2P25067 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL8A2P25067 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL8A2P25067 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL8A2P25067 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL8A2P25067 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL8A2P25067 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL8A2P25067 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL8A2P25067 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL8A2P25067 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL8A2P25067 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL8A2P25067 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL8A2P25067 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL8A2P25067 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL8A2P25067 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL8A2P25067 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL8A2P25067 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL8A2P25067 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL8A2P25067 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL8A2P25067 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL8A2P25067 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL8A2P25067 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COL8A2P25067 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL8A2P25067 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL8A2P25067 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL8A2P25067 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL8A2P25067 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL8A2P25067 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL8A2P25067 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL8A2P25067 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL8A2P25067 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL8A2P25067 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL8A2P25067 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL8A2P25067 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL8A2P25067 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL8A2P25067 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL8A2P25067 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL8A2P25067 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL8A2P25067 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL8A2P25067 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL8A2P25067 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL8A2P25067 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL8A2P25067 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL8A2P25067 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL8A2P25067 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL8A2P25067 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL8A2P25067 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL8A2P25067 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL8A2P25067 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL8A2P25067 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL8A2P25067 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL8A2P25067 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL8A2P25067 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL8A2P25067 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL8A2P25067 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL8A2P25067 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL8A2P25067 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL8A2P25067 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL8A2P25067 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL8A2P25067 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL8A2P25067 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms