Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP24386 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP24386 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP24386 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP24386 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP24386 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP24386 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP24386 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP24386 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP24386 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP24386 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP24386 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP24386 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP24386 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP24386 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP24386 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP24386 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP24386 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP24386 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP24386 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP24386 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP24386 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP24386 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP24386 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP24386 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP24386 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP24386 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP24386 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP24386 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP24386 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP24386 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP24386 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP24386 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP24386 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP24386 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP24386 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP24386 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP24386 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP24386 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP24386 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP24386 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMP24386 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMP24386 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP24386 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP24386 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMP24386 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP24386 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP24386 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP24386 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP24386 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP24386 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP24386 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP24386 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP24386 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP24386 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP24386 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP24386 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP24386 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP24386 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP24386 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP24386 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP24386 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP24386 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP24386 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP24386 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP24386 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP24386 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP24386 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP24386 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP24386 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP24386 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP24386 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP24386 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP24386 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP24386 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP24386 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP24386 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP24386 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP24386 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP24386 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP24386 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP24386 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP24386 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP24386 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP24386 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP24386 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP24386 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP24386 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP24386 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP24386 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP24386 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP24386 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP24386 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP24386 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP24386 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP24386 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP24386 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP24386 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP24386 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP24386 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms