Protein–RNA interactions for Protein: P24158

PRTN3, Myeloblastin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTN3P24158 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRTN3P24158 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRTN3P24158 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRTN3P24158 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRTN3P24158 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRTN3P24158 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRTN3P24158 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRTN3P24158 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRTN3P24158 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRTN3P24158 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRTN3P24158 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRTN3P24158 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRTN3P24158 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRTN3P24158 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRTN3P24158 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRTN3P24158 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRTN3P24158 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRTN3P24158 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRTN3P24158 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRTN3P24158 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRTN3P24158 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRTN3P24158 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRTN3P24158 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRTN3P24158 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRTN3P24158 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRTN3P24158 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRTN3P24158 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRTN3P24158 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRTN3P24158 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRTN3P24158 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRTN3P24158 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRTN3P24158 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRTN3P24158 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRTN3P24158 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRTN3P24158 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRTN3P24158 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRTN3P24158 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRTN3P24158 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRTN3P24158 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRTN3P24158 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRTN3P24158 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRTN3P24158 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRTN3P24158 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRTN3P24158 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRTN3P24158 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRTN3P24158 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRTN3P24158 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRTN3P24158 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRTN3P24158 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRTN3P24158 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRTN3P24158 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRTN3P24158 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRTN3P24158 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRTN3P24158 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRTN3P24158 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRTN3P24158 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRTN3P24158 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRTN3P24158 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRTN3P24158 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRTN3P24158 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRTN3P24158 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRTN3P24158 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRTN3P24158 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRTN3P24158 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRTN3P24158 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRTN3P24158 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRTN3P24158 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRTN3P24158 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRTN3P24158 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRTN3P24158 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRTN3P24158 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRTN3P24158 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRTN3P24158 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRTN3P24158 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRTN3P24158 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRTN3P24158 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRTN3P24158 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRTN3P24158 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRTN3P24158 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRTN3P24158 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRTN3P24158 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRTN3P24158 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRTN3P24158 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRTN3P24158 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRTN3P24158 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRTN3P24158 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRTN3P24158 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRTN3P24158 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRTN3P24158 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRTN3P24158 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRTN3P24158 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRTN3P24158 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRTN3P24158 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRTN3P24158 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRTN3P24158 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRTN3P24158 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRTN3P24158 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRTN3P24158 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRTN3P24158 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRTN3P24158 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms