Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Hoxd11P23813 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Hoxd11P23813 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Hoxd11P23813 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Hoxd11P23813 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Hoxd11P23813 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Hoxd11P23813 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Hoxd11P23813 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hoxd11P23813 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Hoxd11P23813 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Hoxd11P23813 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Hoxd11P23813 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Hoxd11P23813 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Hoxd11P23813 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Hoxd11P23813 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Hoxd11P23813 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hoxd11P23813 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Hoxd11P23813 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Hoxd11P23813 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hoxd11P23813 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hoxd11P23813 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hoxd11P23813 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Hoxd11P23813 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Hoxd11P23813 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Hoxd11P23813 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Hoxd11P23813 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Hoxd11P23813 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hoxd11P23813 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hoxd11P23813 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Hoxd11P23813 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Hoxd11P23813 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hoxd11P23813 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hoxd11P23813 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hoxd11P23813 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Hoxd11P23813 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Hoxd11P23813 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Hoxd11P23813 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Hoxd11P23813 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Hoxd11P23813 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Hoxd11P23813 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Hoxd11P23813 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Hoxd11P23813 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Hoxd11P23813 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hoxd11P23813 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Hoxd11P23813 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Hoxd11P23813 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Hoxd11P23813 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hoxd11P23813 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Hoxd11P23813 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Hoxd11P23813 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hoxd11P23813 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hoxd11P23813 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Hoxd11P23813 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hoxd11P23813 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Hoxd11P23813 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Hoxd11P23813 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Hoxd11P23813 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hoxd11P23813 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Hoxd11P23813 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Hoxd11P23813 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Hoxd11P23813 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Hoxd11P23813 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hoxd11P23813 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hoxd11P23813 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hoxd11P23813 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hoxd11P23813 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Hoxd11P23813 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hoxd11P23813 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Hoxd11P23813 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Hoxd11P23813 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Hoxd11P23813 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hoxd11P23813 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hoxd11P23813 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hoxd11P23813 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Hoxd11P23813 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hoxd11P23813 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hoxd11P23813 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hoxd11P23813 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hoxd11P23813 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Hoxd11P23813 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Hoxd11P23813 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Hoxd11P23813 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hoxd11P23813 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Hoxd11P23813 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hoxd11P23813 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Hoxd11P23813 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hoxd11P23813 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Hoxd11P23813 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Hoxd11P23813 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hoxd11P23813 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hoxd11P23813 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hoxd11P23813 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hoxd11P23813 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hoxd11P23813 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hoxd11P23813 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Hoxd11P23813 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Hoxd11P23813 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Hoxd11P23813 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Hoxd11P23813 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Hoxd11P23813 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms