Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.156e-16■■■■■ 65.8
RPS3P23396 DOCK5-205ENST00000467709 4844 ntTSL 57.06□□□□□ -1.286e-16■■■■■ 65.8
RPS3P23396 MRPS28-209ENST00000522987 487 ntTSL 314.69□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 65.8
RPS3P23396 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 65.8
RPS3P23396 MRPS28-202ENST00000518271 487 ntTSL 511.84□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 65.8
RPS3P23396 MRPS28-208ENST00000521605 437 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 65.8
RPS3P23396 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.352e-9■■■■■ 65.8
RPS3P23396 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 65.8
RPS3P23396 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 65.8
RPS3P23396 THYN1-201ENST00000341541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 65.8
RPS3P23396 THYN1-204ENST00000392595 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 65.8
RPS3P23396 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.742e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.28e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.028e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 FBP1-202ENST00000414122 629 ntTSL 512.76□□□□□ -0.378e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-202ENST00000429243 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.378e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PAPSS1-208ENST00000514815 296 ntTSL 512.67□□□□□ -0.388e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 COPB1-209ENST00000533096 547 ntTSL 412.26□□□□□ -0.451e-18■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.68e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-208ENST00000549740 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.658e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 DYNLRB1-204ENST00000480759 1053 ntTSL 310.36□□□□□ -0.752e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-213ENST00000552846 407 ntTSL 310.28□□□□□ -0.768e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-201ENST00000379786 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.848e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-210ENST00000551003 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.948e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 CTH-203ENST00000411986 2044 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.068e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 CTH-201ENST00000346806 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.148e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-207ENST00000549581 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.148e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.158e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-205ENST00000549068 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.158e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.172e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.228e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.268e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRR13-212ENST00000551945 261 ntAPPRIS ALT2 TSL 36.26□□□□□ -1.418e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.94□□□□□ -1.788e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 PRDX4-204ENST00000439422 554 ntTSL 31.35□□□□□ -2.198e-10■■■■■ 65.7
RPS3P23396 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.184e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 TSPAN7-208ENST00000494037 575 ntTSL 48□□□□□ -1.134e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 TSPAN7-206ENST00000480976 553 ntTSL 45.91□□□□□ -1.464e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 ESD-203ENST00000412582 921 ntTSL 34.29□□□□□ -1.724e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.874e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 ESD-204ENST00000471867 2410 ntTSL 21.91□□□□□ -2.14e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 ESD-205ENST00000495654 701 ntTSL 51.28□□□□□ -2.24e-12■■■■■ 65.3
RPS3P23396 PSMB3-207ENST00000610434 510 ntTSL 310.39□□□□□ -0.752e-9■■■■■ 65
RPS3P23396 NDUFA4-203ENST00000470761 502 ntTSL 414.11□□□□□ -0.154e-9■■■■■ 64.8
RPS3P23396 SLC25A3-205ENST00000547444 517 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.19e-21■■■■■ 64
RPS3P23396 PSMB3-210ENST00000618159 562 ntTSL 28.41□□□□□ -1.061e-22■■■■■ 63.6
RPS3P23396 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.337e-18■■■■■ 63.4
RPS3P23396 AP000787.1-206ENST00000543150 1567 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.557e-18■■■■■ 63.4
RPS3P23396 AP000787.1-204ENST00000534891 777 ntTSL 27.45□□□□□ -1.227e-18■■■■■ 63.4
RPS3P23396 AP000787.1-207ENST00000540692 1201 ntTSL 26.38□□□□□ -1.397e-18■■■■■ 63.4
RPS3P23396 NDUFA4-204ENST00000482299 606 ntTSL 21.17□□□□□ -2.228e-10■■■■■ 63.3
RPS3P23396 LIPM-202ENST00000539337 1197 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.873e-9■■■■■ 63.3
RPS3P23396 LIPM-201ENST00000404743 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.943e-9■■■■■ 63.3
RPS3P23396 UQCRC1-210ENST00000493806 567 ntTSL 415.45■□□□□ 0.069e-10■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.184e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-201ENST00000264258 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-211ENST00000456292 357 ntTSL 24.72□□□□□ -1.654e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-210ENST00000441435 717 ntTSL 23.78□□□□□ -1.84e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPL31-209ENST00000419276 781 ntTSL 53.27□□□□□ -1.894e-7■■■■■ 63.3
RPS3P23396 RPS7-209ENST00000491937 987 ntTSL 225.16■■□□□ 1.622e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-205ENST00000462576 907 ntTSL 1 (best)25.16■■□□□ 1.622e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-207ENST00000479123 511 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.12e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-208ENST00000481006 5429 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.052e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-203ENST00000406376 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.752e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.082e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.322e-11■■■■■ 63.2
RPS3P23396 PSMB5-206ENST00000555895 444 ntTSL 313.75□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 62.9
RPS3P23396 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 62.5
RPS3P23396 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 62.5
RPS3P23396 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 62.4
RPS3P23396 PSMB3-208ENST00000613870 662 ntTSL 38.27□□□□□ -1.092e-9■■■■■ 62.4
RPS3P23396 PSMB3-212ENST00000620309 552 ntTSL 26.97□□□□□ -1.292e-9■■■■■ 62.4
RPS3P23396 RPS17-203ENST00000559273 580 ntTSL 215.08■□□□□ 04e-15■■■■■ 62
RPS3P23396 AC245033.1-201ENST00000562833 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.954e-15■■■■■ 62
RPS3P23396 APOL1-209ENST00000433768 541 ntTSL 413.78□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 62
RPS3P23396 APOL1-204ENST00000422471 561 ntTSL 413.02□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 62
RPS3P23396 APOL1-208ENST00000431184 550 ntTSL 412.16□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 62
RPS3P23396 APOL1-210ENST00000438034 566 ntTSL 411.11□□□□□ -0.632e-9■■■■■ 62
RPS3P23396 APOL1-212ENST00000475519 600 ntTSL 49.47□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 62
RPS3P23396 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.165e-8■■■■■ 61.6
RPS3P23396 MRPS21-202ENST00000614145 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.775e-8■■■■■ 61.6
RPS3P23396 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-323■■■■■ 61.4
RPS3P23396 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.271e-323■■■■■ 61.4
RPS3P23396 NDUFB9-207ENST00000524241 654 ntTSL 26.98□□□□□ -1.293e-9■■■■■ 61.3
RPS3P23396 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.321e-14■■■■■ 61
RPS3P23396 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-14■■■■■ 61
RPS3P23396 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.151e-14■■■■■ 61
RPS3P23396 ZFP64-212ENST00000477786 909 ntTSL 514.02□□□□□ -0.171e-14■■■■■ 61
RPS3P23396 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.611e-14■■■■■ 61
RPS3P23396 ZFP64-204ENST00000371515 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.721e-14■■■■■ 61
RPS3P23396 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.954e-17■■■■■ 60.8
RPS3P23396 RBM42-207ENST00000592526 1012 ntTSL 220.32■□□□□ 0.844e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.714e-9■■■■■ 60.8
RPS3P23396 PLEKHG4-209ENST00000563969 6949 ntTSL 216.38■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 60.8
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