Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKACBP22694 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKACBP22694 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKACBP22694 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKACBP22694 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKACBP22694 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKACBP22694 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKACBP22694 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKACBP22694 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKACBP22694 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKACBP22694 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKACBP22694 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKACBP22694 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKACBP22694 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKACBP22694 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKACBP22694 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKACBP22694 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKACBP22694 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKACBP22694 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKACBP22694 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKACBP22694 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKACBP22694 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKACBP22694 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKACBP22694 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKACBP22694 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKACBP22694 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKACBP22694 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKACBP22694 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKACBP22694 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKACBP22694 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKACBP22694 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKACBP22694 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKACBP22694 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKACBP22694 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKACBP22694 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKACBP22694 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKACBP22694 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKACBP22694 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKACBP22694 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKACBP22694 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKACBP22694 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKACBP22694 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKACBP22694 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKACBP22694 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKACBP22694 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKACBP22694 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKACBP22694 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKACBP22694 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKACBP22694 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKACBP22694 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKACBP22694 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKACBP22694 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKACBP22694 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKACBP22694 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKACBP22694 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKACBP22694 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKACBP22694 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKACBP22694 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKACBP22694 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKACBP22694 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKACBP22694 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKACBP22694 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKACBP22694 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKACBP22694 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKACBP22694 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKACBP22694 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKACBP22694 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKACBP22694 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKACBP22694 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKACBP22694 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKACBP22694 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKACBP22694 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKACBP22694 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKACBP22694 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKACBP22694 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKACBP22694 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKACBP22694 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKACBP22694 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKACBP22694 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKACBP22694 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKACBP22694 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKACBP22694 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKACBP22694 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKACBP22694 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKACBP22694 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKACBP22694 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKACBP22694 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKACBP22694 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKACBP22694 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKACBP22694 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKACBP22694 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKACBP22694 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKACBP22694 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKACBP22694 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKACBP22694 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKACBP22694 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKACBP22694 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKACBP22694 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKACBP22694 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKACBP22694 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms