Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNOP22674 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNOP22674 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNOP22674 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNOP22674 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNOP22674 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNOP22674 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNOP22674 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNOP22674 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNOP22674 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNOP22674 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNOP22674 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNOP22674 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNOP22674 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNOP22674 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNOP22674 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNOP22674 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNOP22674 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNOP22674 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNOP22674 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNOP22674 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNOP22674 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNOP22674 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNOP22674 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNOP22674 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNOP22674 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNOP22674 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNOP22674 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNOP22674 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNOP22674 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNOP22674 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNOP22674 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNOP22674 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNOP22674 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNOP22674 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNOP22674 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNOP22674 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNOP22674 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNOP22674 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNOP22674 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNOP22674 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNOP22674 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNOP22674 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNOP22674 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNOP22674 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNOP22674 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNOP22674 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNOP22674 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNOP22674 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNOP22674 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNOP22674 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNOP22674 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNOP22674 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNOP22674 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNOP22674 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNOP22674 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNOP22674 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNOP22674 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNOP22674 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNOP22674 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNOP22674 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNOP22674 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNOP22674 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNOP22674 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNOP22674 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNOP22674 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNOP22674 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNOP22674 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNOP22674 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNOP22674 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNOP22674 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNOP22674 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNOP22674 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNOP22674 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNOP22674 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNOP22674 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNOP22674 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNOP22674 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNOP22674 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNOP22674 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNOP22674 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNOP22674 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNOP22674 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNOP22674 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNOP22674 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNOP22674 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNOP22674 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNOP22674 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNOP22674 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNOP22674 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNOP22674 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNOP22674 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNOP22674 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNOP22674 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNOP22674 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNOP22674 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNOP22674 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNOP22674 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNOP22674 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNOP22674 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms