Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPRR1BP22528 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPRR1BP22528 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPRR1BP22528 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPRR1BP22528 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPRR1BP22528 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPRR1BP22528 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRR1BP22528 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPRR1BP22528 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPRR1BP22528 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPRR1BP22528 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRR1BP22528 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPRR1BP22528 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPRR1BP22528 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPRR1BP22528 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRR1BP22528 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPRR1BP22528 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRR1BP22528 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRR1BP22528 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPRR1BP22528 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPRR1BP22528 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPRR1BP22528 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPRR1BP22528 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPRR1BP22528 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPRR1BP22528 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPRR1BP22528 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPRR1BP22528 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPRR1BP22528 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPRR1BP22528 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPRR1BP22528 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPRR1BP22528 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPRR1BP22528 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPRR1BP22528 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPRR1BP22528 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPRR1BP22528 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPRR1BP22528 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRR1BP22528 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRR1BP22528 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRR1BP22528 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPRR1BP22528 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPRR1BP22528 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPRR1BP22528 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPRR1BP22528 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPRR1BP22528 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPRR1BP22528 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPRR1BP22528 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPRR1BP22528 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms