Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FGFR4P22455 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FGFR4P22455 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FGFR4P22455 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGFR4P22455 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FGFR4P22455 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FGFR4P22455 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGFR4P22455 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FGFR4P22455 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FGFR4P22455 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FGFR4P22455 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FGFR4P22455 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FGFR4P22455 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FGFR4P22455 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
FGFR4P22455 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FGFR4P22455 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FGFR4P22455 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FGFR4P22455 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FGFR4P22455 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FGFR4P22455 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FGFR4P22455 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FGFR4P22455 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FGFR4P22455 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FGFR4P22455 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGFR4P22455 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGFR4P22455 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGFR4P22455 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGFR4P22455 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FGFR4P22455 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FGFR4P22455 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FGFR4P22455 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FGFR4P22455 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FGFR4P22455 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FGFR4P22455 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FGFR4P22455 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FGFR4P22455 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FGFR4P22455 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
FGFR4P22455 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FGFR4P22455 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FGFR4P22455 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FGFR4P22455 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FGFR4P22455 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FGFR4P22455 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FGFR4P22455 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FGFR4P22455 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FGFR4P22455 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FGFR4P22455 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FGFR4P22455 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FGFR4P22455 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FGFR4P22455 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FGFR4P22455 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FGFR4P22455 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FGFR4P22455 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
FGFR4P22455 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FGFR4P22455 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FGFR4P22455 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FGFR4P22455 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FGFR4P22455 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FGFR4P22455 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FGFR4P22455 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FGFR4P22455 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FGFR4P22455 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FGFR4P22455 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
FGFR4P22455 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
FGFR4P22455 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FGFR4P22455 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FGFR4P22455 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FGFR4P22455 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FGFR4P22455 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FGFR4P22455 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FGFR4P22455 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FGFR4P22455 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FGFR4P22455 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FGFR4P22455 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FGFR4P22455 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
FGFR4P22455 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FGFR4P22455 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FGFR4P22455 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FGFR4P22455 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
FGFR4P22455 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FGFR4P22455 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
FGFR4P22455 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FGFR4P22455 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FGFR4P22455 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FGFR4P22455 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
FGFR4P22455 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FGFR4P22455 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FGFR4P22455 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FGFR4P22455 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
FGFR4P22455 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FGFR4P22455 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FGFR4P22455 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FGFR4P22455 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FGFR4P22455 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FGFR4P22455 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FGFR4P22455 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FGFR4P22455 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FGFR4P22455 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FGFR4P22455 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FGFR4P22455 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms