Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zfp42P22227 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zfp42P22227 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zfp42P22227 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zfp42P22227 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zfp42P22227 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp42P22227 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zfp42P22227 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zfp42P22227 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zfp42P22227 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfp42P22227 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zfp42P22227 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zfp42P22227 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zfp42P22227 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zfp42P22227 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zfp42P22227 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zfp42P22227 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zfp42P22227 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zfp42P22227 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zfp42P22227 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Zfp42P22227 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zfp42P22227 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp42P22227 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zfp42P22227 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfp42P22227 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zfp42P22227 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zfp42P22227 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zfp42P22227 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zfp42P22227 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zfp42P22227 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zfp42P22227 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zfp42P22227 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfp42P22227 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zfp42P22227 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfp42P22227 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp42P22227 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfp42P22227 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfp42P22227 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zfp42P22227 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zfp42P22227 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zfp42P22227 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zfp42P22227 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zfp42P22227 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zfp42P22227 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zfp42P22227 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Zfp42P22227 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zfp42P22227 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zfp42P22227 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zfp42P22227 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zfp42P22227 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp42P22227 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zfp42P22227 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zfp42P22227 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zfp42P22227 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zfp42P22227 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zfp42P22227 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zfp42P22227 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zfp42P22227 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zfp42P22227 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zfp42P22227 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zfp42P22227 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zfp42P22227 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Zfp42P22227 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zfp42P22227 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zfp42P22227 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zfp42P22227 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zfp42P22227 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zfp42P22227 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Zfp42P22227 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zfp42P22227 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zfp42P22227 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zfp42P22227 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zfp42P22227 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Zfp42P22227 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Zfp42P22227 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zfp42P22227 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Zfp42P22227 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp42P22227 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zfp42P22227 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp42P22227 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp42P22227 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp42P22227 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp42P22227 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfp42P22227 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfp42P22227 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfp42P22227 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp42P22227 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp42P22227 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zfp42P22227 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zfp42P22227 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zfp42P22227 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zfp42P22227 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zfp42P22227 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp42P22227 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp42P22227 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfp42P22227 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp42P22227 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zfp42P22227 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfp42P22227 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zfp42P22227 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms