Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHA1P21709 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHA1P21709 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA1P21709 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA1P21709 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA1P21709 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA1P21709 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA1P21709 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA1P21709 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHA1P21709 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHA1P21709 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHA1P21709 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHA1P21709 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHA1P21709 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA1P21709 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA1P21709 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA1P21709 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA1P21709 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHA1P21709 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHA1P21709 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHA1P21709 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA1P21709 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA1P21709 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA1P21709 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA1P21709 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHA1P21709 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA1P21709 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA1P21709 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHA1P21709 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA1P21709 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA1P21709 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA1P21709 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA1P21709 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA1P21709 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA1P21709 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA1P21709 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA1P21709 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA1P21709 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA1P21709 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA1P21709 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA1P21709 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA1P21709 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA1P21709 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EPHA1P21709 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA1P21709 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA1P21709 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA1P21709 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA1P21709 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA1P21709 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA1P21709 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA1P21709 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA1P21709 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA1P21709 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA1P21709 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA1P21709 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA1P21709 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA1P21709 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA1P21709 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA1P21709 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA1P21709 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA1P21709 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA1P21709 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHA1P21709 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHA1P21709 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA1P21709 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA1P21709 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA1P21709 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA1P21709 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA1P21709 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA1P21709 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA1P21709 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA1P21709 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA1P21709 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA1P21709 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA1P21709 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA1P21709 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA1P21709 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA1P21709 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA1P21709 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA1P21709 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA1P21709 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA1P21709 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA1P21709 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA1P21709 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA1P21709 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA1P21709 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA1P21709 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA1P21709 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA1P21709 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA1P21709 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA1P21709 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA1P21709 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA1P21709 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA1P21709 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA1P21709 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA1P21709 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA1P21709 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPHA1P21709 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA1P21709 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA1P21709 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms