Protein–RNA interactions for Protein: P21242

PRE10, Probable proteasome subunit alpha type-7, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRE10P21242 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.81□□□□□ -0.2
PRE10P21242 PHO4YFR034C 939 nt13.77□□□□□ -0.21
PRE10P21242 CCT6YDR188W 1641 nt13.72□□□□□ -0.21
PRE10P21242 ADO1YJR105W 1023 nt13.71□□□□□ -0.21
PRE10P21242 BDF1YLR399C 2061 nt13.69□□□□□ -0.22
PRE10P21242 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.63□□□□□ -0.23
PRE10P21242 YEL076CYEL076C 651 nt13.63□□□□□ -0.23
PRE10P21242 UBX6YJL048C 1191 nt13.63□□□□□ -0.23
PRE10P21242 YLR464WYLR464W 651 nt13.63□□□□□ -0.23
PRE10P21242 LPX1YOR084W 1164 nt13.62□□□□□ -0.23
PRE10P21242 MEP2YNL142W 1500 nt13.61□□□□□ -0.23
PRE10P21242 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.58□□□□□ -0.24
PRE10P21242 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.58□□□□□ -0.24
PRE10P21242 YJL152WYJL152W 360 nt13.58□□□□□ -0.24
PRE10P21242 ERV46YAL042W 1248 nt13.58□□□□□ -0.24
PRE10P21242 SPP1YPL138C 1062 nt13.58□□□□□ -0.24
PRE10P21242 ALF1YNL148C 765 nt13.53□□□□□ -0.24
PRE10P21242 IDH1YNL037C 1083 nt13.52□□□□□ -0.25
PRE10P21242 RTG1YOL067C 534 nt13.52□□□□□ -0.25
PRE10P21242 TAT1YBR069C 1860 nt13.49□□□□□ -0.25
PRE10P21242 SIS1YNL007C 1059 nt13.49□□□□□ -0.25
PRE10P21242 YDR433WYDR433W 441 nt13.46□□□□□ -0.25
PRE10P21242 YPS1YLR120C 1710 nt13.43□□□□□ -0.26
PRE10P21242 YKR040CYKR040C 504 nt13.42□□□□□ -0.26
PRE10P21242 DCW1YKL046C 1350 nt13.41□□□□□ -0.26
PRE10P21242 YDR095CYDR095C 411 nt13.33□□□□□ -0.28
PRE10P21242 GBP2YCL011C 1284 nt13.33□□□□□ -0.28
PRE10P21242 HUA1YGR268C 597 nt13.3□□□□□ -0.28
PRE10P21242 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.29□□□□□ -0.28
PRE10P21242 MXR2YCL033C 507 nt13.29□□□□□ -0.28
PRE10P21242 YDR094WYDR094W 336 nt13.26□□□□□ -0.29
PRE10P21242 TIR4YOR009W 1464 nt13.26□□□□□ -0.29
PRE10P21242 YBR220CYBR220C 1683 nt13.19□□□□□ -0.3
PRE10P21242 EMI2YDR516C 1503 nt13.18□□□□□ -0.3
PRE10P21242 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.17□□□□□ -0.3
PRE10P21242 CAC2YML102W 1407 nt13.13□□□□□ -0.31 RIP-Chip
PRE10P21242 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.09□□□□□ -0.31
PRE10P21242 TCD2YKL027W 1344 nt13.09□□□□□ -0.31
PRE10P21242 PAC11YDR488C 1602 nt13.07□□□□□ -0.32
PRE10P21242 YMR090WYMR090W 684 nt13.07□□□□□ -0.32
PRE10P21242 RPP2AYOL039W 321 nt13.07□□□□□ -0.32
PRE10P21242 YMR057CYMR057C 372 nt13.06□□□□□ -0.32
PRE10P21242 YDL221WYDL221W 552 nt13.04□□□□□ -0.32
PRE10P21242 PTP1YDL230W 1008 nt13.04□□□□□ -0.32
PRE10P21242 ART5YGR068C 1761 nt13.04□□□□□ -0.32
PRE10P21242 PET9YBL030C 957 nt13.02□□□□□ -0.33
PRE10P21242 SDH1YKL148C 1923 nt13.01□□□□□ -0.33
PRE10P21242 FRD1YEL047C 1413 nt13□□□□□ -0.33
PRE10P21242 PTH1YHR189W 573 nt12.94□□□□□ -0.34
PRE10P21242 YKL030WYKL030W 606 nt12.93□□□□□ -0.34
PRE10P21242 DED1YOR204W 1815 nt12.92□□□□□ -0.34
PRE10P21242 GFD2YCL036W 1701 nt12.91□□□□□ -0.34
PRE10P21242 YLR235CYLR235C 399 nt12.89□□□□□ -0.35
PRE10P21242 RRD1YIL153W 1182 nt12.87□□□□□ -0.35
PRE10P21242 YCL042WYCL042W 360 nt12.86□□□□□ -0.35
PRE10P21242 PCH2YBR186W 1695 nt12.84□□□□□ -0.35
PRE10P21242 GUT2YIL155C 1950 nt12.82□□□□□ -0.36
PRE10P21242 SBA1YKL117W 651 nt12.82□□□□□ -0.36
PRE10P21242 SCC4YER147C 1875 nt12.81□□□□□ -0.36
PRE10P21242 LCB1YMR296C 1677 nt12.8□□□□□ -0.36
PRE10P21242 IRC15YPL017C 1500 nt12.79□□□□□ -0.36
PRE10P21242 SOR2YDL246C 1074 nt12.78□□□□□ -0.36
PRE10P21242 SOR1YJR159W 1074 nt12.78□□□□□ -0.36
PRE10P21242 FPS1YLL043W 2010 nt12.78□□□□□ -0.36
PRE10P21242 PAU16YKL224C 372 nt12.76□□□□□ -0.37
PRE10P21242 FMT1YBL013W 1206 nt12.76□□□□□ -0.37
PRE10P21242 SEC11YIR022W 504 nt12.75□□□□□ -0.37
PRE10P21242 GIS3YLR094C 1509 nt12.72□□□□□ -0.37
PRE10P21242 RTS2YOR077W 699 nt12.7□□□□□ -0.38
PRE10P21242 YFR018CYFR018C 1092 nt12.69□□□□□ -0.38
PRE10P21242 RRT5YFR032C 870 nt12.68□□□□□ -0.38
PRE10P21242 PIB2YGL023C 1908 nt12.66□□□□□ -0.38
PRE10P21242 NVJ2YPR091C 2313 nt12.66□□□□□ -0.38
PRE10P21242 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.64□□□□□ -0.39
PRE10P21242 YSC84YHR016C 1407 nt12.62□□□□□ -0.39
PRE10P21242 CWP1YKL096W 720 nt12.6□□□□□ -0.39
PRE10P21242 PRE6YOL038W 765 nt12.6□□□□□ -0.39
PRE10P21242 FMP52YER004W 696 nt12.59□□□□□ -0.39
PRE10P21242 TIM23YNR017W 669 nt12.58□□□□□ -0.4
PRE10P21242 CUE1YMR264W 612 nt12.57□□□□□ -0.4
PRE10P21242 YHL050CYHL050C 2094 nt12.55□□□□□ -0.4
PRE10P21242 ADH2YMR303C 1047 nt12.54□□□□□ -0.4
PRE10P21242 DIC1YLR348C 897 nt12.52□□□□□ -0.41
PRE10P21242 SNF6YHL025W 999 nt12.49□□□□□ -0.41
PRE10P21242 YLR179CYLR179C 606 nt12.49□□□□□ -0.41
PRE10P21242 YPR064WYPR064W 420 nt12.48□□□□□ -0.41
PRE10P21242 RTF1YGL244W 1677 nt12.47□□□□□ -0.41
PRE10P21242 YIL100WYIL100W 354 nt12.43□□□□□ -0.42
PRE10P21242 RRT12YCR045C 1476 nt12.42□□□□□ -0.42
PRE10P21242 TAD3YLR316C 969 nt12.42□□□□□ -0.42
PRE10P21242 PCM1YEL058W 1674 nt12.36□□□□□ -0.43
PRE10P21242 YFL066CYFL066C 1179 nt12.36□□□□□ -0.43
PRE10P21242 NAT4YMR069W 858 nt12.35□□□□□ -0.43
PRE10P21242 WSC2YNL283C 1512 nt12.34□□□□□ -0.43
PRE10P21242 PTK1YKL198C 1989 nt12.33□□□□□ -0.44
PRE10P21242 AHT1YHR093W 549 nt12.33□□□□□ -0.44
PRE10P21242 BOP3YNL042W 1191 nt12.33□□□□□ -0.44
PRE10P21242 RNQ1YCL028W 1218 nt12.33□□□□□ -0.44
PRE10P21242 PEX25YPL112C 1185 nt12.31□□□□□ -0.44
PRE10P21242 YNL195CYNL195C 786 nt12.3□□□□□ -0.44
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