Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD247P20963 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD247P20963 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CD247P20963 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CD247P20963 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD247P20963 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD247P20963 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD247P20963 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD247P20963 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD247P20963 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD247P20963 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CD247P20963 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD247P20963 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD247P20963 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD247P20963 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD247P20963 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD247P20963 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD247P20963 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD247P20963 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD247P20963 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD247P20963 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD247P20963 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD247P20963 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD247P20963 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD247P20963 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD247P20963 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD247P20963 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD247P20963 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD247P20963 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD247P20963 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD247P20963 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD247P20963 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD247P20963 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CD247P20963 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD247P20963 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CD247P20963 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CD247P20963 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CD247P20963 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CD247P20963 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CD247P20963 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CD247P20963 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD247P20963 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD247P20963 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD247P20963 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD247P20963 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD247P20963 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD247P20963 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD247P20963 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD247P20963 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD247P20963 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD247P20963 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD247P20963 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD247P20963 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD247P20963 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD247P20963 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD247P20963 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD247P20963 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD247P20963 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD247P20963 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD247P20963 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD247P20963 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD247P20963 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD247P20963 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD247P20963 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD247P20963 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD247P20963 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD247P20963 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD247P20963 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD247P20963 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD247P20963 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD247P20963 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD247P20963 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD247P20963 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD247P20963 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD247P20963 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD247P20963 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD247P20963 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD247P20963 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD247P20963 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD247P20963 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD247P20963 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD247P20963 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD247P20963 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD247P20963 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD247P20963 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CD247P20963 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD247P20963 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD247P20963 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD247P20963 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD247P20963 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD247P20963 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD247P20963 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD247P20963 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD247P20963 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD247P20963 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD247P20963 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD247P20963 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD247P20963 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD247P20963 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD247P20963 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms