Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BPBP20851 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BPBP20851 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BPBP20851 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BPBP20851 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BPBP20851 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BPBP20851 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BPBP20851 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BPBP20851 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BPBP20851 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4BPBP20851 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4BPBP20851 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4BPBP20851 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4BPBP20851 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4BPBP20851 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4BPBP20851 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4BPBP20851 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4BPBP20851 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4BPBP20851 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4BPBP20851 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4BPBP20851 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4BPBP20851 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4BPBP20851 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4BPBP20851 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4BPBP20851 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4BPBP20851 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C4BPBP20851 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C4BPBP20851 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BPBP20851 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BPBP20851 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BPBP20851 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BPBP20851 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BPBP20851 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BPBP20851 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BPBP20851 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BPBP20851 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BPBP20851 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BPBP20851 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BPBP20851 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BPBP20851 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BPBP20851 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BPBP20851 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BPBP20851 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4BPBP20851 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4BPBP20851 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4BPBP20851 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4BPBP20851 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BPBP20851 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BPBP20851 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BPBP20851 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BPBP20851 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BPBP20851 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4BPBP20851 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4BPBP20851 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4BPBP20851 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BPBP20851 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BPBP20851 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BPBP20851 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4BPBP20851 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4BPBP20851 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4BPBP20851 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4BPBP20851 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4BPBP20851 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BPBP20851 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4BPBP20851 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4BPBP20851 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4BPBP20851 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4BPBP20851 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4BPBP20851 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4BPBP20851 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4BPBP20851 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4BPBP20851 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4BPBP20851 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4BPBP20851 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4BPBP20851 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C4BPBP20851 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BPBP20851 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BPBP20851 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BPBP20851 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BPBP20851 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BPBP20851 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BPBP20851 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BPBP20851 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4BPBP20851 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4BPBP20851 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4BPBP20851 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4BPBP20851 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4BPBP20851 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms