Protein–RNA interactions for Protein: P17612

PRKACA, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACAP17612 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKACAP17612 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKACAP17612 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKACAP17612 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKACAP17612 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKACAP17612 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKACAP17612 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKACAP17612 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKACAP17612 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKACAP17612 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKACAP17612 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKACAP17612 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKACAP17612 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKACAP17612 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKACAP17612 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKACAP17612 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKACAP17612 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKACAP17612 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKACAP17612 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKACAP17612 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKACAP17612 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKACAP17612 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKACAP17612 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKACAP17612 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKACAP17612 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKACAP17612 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKACAP17612 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKACAP17612 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKACAP17612 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKACAP17612 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKACAP17612 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKACAP17612 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKACAP17612 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKACAP17612 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKACAP17612 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKACAP17612 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKACAP17612 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKACAP17612 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKACAP17612 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKACAP17612 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKACAP17612 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKACAP17612 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKACAP17612 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKACAP17612 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKACAP17612 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKACAP17612 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKACAP17612 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKACAP17612 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKACAP17612 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKACAP17612 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKACAP17612 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKACAP17612 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKACAP17612 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKACAP17612 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKACAP17612 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKACAP17612 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKACAP17612 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKACAP17612 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKACAP17612 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKACAP17612 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKACAP17612 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKACAP17612 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKACAP17612 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKACAP17612 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKACAP17612 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKACAP17612 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKACAP17612 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKACAP17612 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKACAP17612 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKACAP17612 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKACAP17612 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKACAP17612 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKACAP17612 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKACAP17612 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKACAP17612 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKACAP17612 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKACAP17612 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKACAP17612 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKACAP17612 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKACAP17612 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKACAP17612 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKACAP17612 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKACAP17612 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKACAP17612 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKACAP17612 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKACAP17612 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKACAP17612 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKACAP17612 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms