Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CKMT2P17540 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CKMT2P17540 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CKMT2P17540 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CKMT2P17540 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CKMT2P17540 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CKMT2P17540 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CKMT2P17540 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CKMT2P17540 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CKMT2P17540 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CKMT2P17540 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CKMT2P17540 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CKMT2P17540 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CKMT2P17540 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CKMT2P17540 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CKMT2P17540 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CKMT2P17540 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CKMT2P17540 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CKMT2P17540 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CKMT2P17540 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CKMT2P17540 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CKMT2P17540 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CKMT2P17540 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CKMT2P17540 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CKMT2P17540 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CKMT2P17540 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CKMT2P17540 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CKMT2P17540 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CKMT2P17540 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CKMT2P17540 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CKMT2P17540 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CKMT2P17540 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CKMT2P17540 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKMT2P17540 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CKMT2P17540 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CKMT2P17540 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CKMT2P17540 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CKMT2P17540 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CKMT2P17540 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CKMT2P17540 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CKMT2P17540 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CKMT2P17540 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CKMT2P17540 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CKMT2P17540 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CKMT2P17540 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CKMT2P17540 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CKMT2P17540 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CKMT2P17540 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKMT2P17540 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKMT2P17540 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKMT2P17540 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKMT2P17540 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CKMT2P17540 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CKMT2P17540 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKMT2P17540 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CKMT2P17540 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CKMT2P17540 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CKMT2P17540 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKMT2P17540 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKMT2P17540 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKMT2P17540 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CKMT2P17540 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKMT2P17540 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CKMT2P17540 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CKMT2P17540 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CKMT2P17540 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CKMT2P17540 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CKMT2P17540 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CKMT2P17540 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CKMT2P17540 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CKMT2P17540 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CKMT2P17540 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CKMT2P17540 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CKMT2P17540 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CKMT2P17540 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKMT2P17540 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKMT2P17540 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CKMT2P17540 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CKMT2P17540 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKMT2P17540 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKMT2P17540 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CKMT2P17540 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CKMT2P17540 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKMT2P17540 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKMT2P17540 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CKMT2P17540 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKMT2P17540 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKMT2P17540 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CKMT2P17540 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CKMT2P17540 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CKMT2P17540 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKMT2P17540 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKMT2P17540 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CKMT2P17540 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CKMT2P17540 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CKMT2P17540 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CKMT2P17540 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CKMT2P17540 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKMT2P17540 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CKMT2P17540 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms