Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTRB1P17538 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTRB1P17538 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTRB1P17538 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTRB1P17538 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTRB1P17538 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTRB1P17538 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTRB1P17538 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTRB1P17538 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTRB1P17538 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTRB1P17538 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTRB1P17538 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTRB1P17538 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTRB1P17538 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTRB1P17538 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTRB1P17538 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTRB1P17538 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTRB1P17538 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTRB1P17538 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTRB1P17538 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTRB1P17538 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTRB1P17538 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTRB1P17538 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTRB1P17538 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTRB1P17538 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTRB1P17538 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTRB1P17538 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTRB1P17538 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTRB1P17538 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTRB1P17538 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTRB1P17538 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTRB1P17538 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTRB1P17538 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTRB1P17538 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTRB1P17538 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTRB1P17538 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTRB1P17538 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTRB1P17538 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTRB1P17538 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTRB1P17538 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTRB1P17538 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTRB1P17538 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTRB1P17538 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTRB1P17538 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTRB1P17538 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTRB1P17538 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTRB1P17538 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTRB1P17538 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTRB1P17538 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTRB1P17538 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTRB1P17538 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTRB1P17538 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTRB1P17538 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTRB1P17538 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTRB1P17538 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTRB1P17538 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTRB1P17538 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTRB1P17538 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTRB1P17538 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTRB1P17538 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTRB1P17538 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTRB1P17538 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTRB1P17538 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTRB1P17538 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTRB1P17538 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTRB1P17538 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTRB1P17538 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTRB1P17538 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTRB1P17538 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTRB1P17538 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTRB1P17538 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTRB1P17538 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTRB1P17538 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTRB1P17538 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTRB1P17538 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTRB1P17538 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTRB1P17538 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTRB1P17538 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTRB1P17538 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTRB1P17538 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTRB1P17538 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTRB1P17538 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTRB1P17538 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTRB1P17538 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTRB1P17538 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTRB1P17538 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTRB1P17538 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms