Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
VAV1P15498 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
VAV1P15498 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAV1P15498 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAV1P15498 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAV1P15498 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VAV1P15498 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VAV1P15498 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAV1P15498 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAV1P15498 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VAV1P15498 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAV1P15498 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAV1P15498 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VAV1P15498 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VAV1P15498 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAV1P15498 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAV1P15498 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VAV1P15498 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VAV1P15498 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAV1P15498 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAV1P15498 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAV1P15498 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAV1P15498 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAV1P15498 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAV1P15498 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
VAV1P15498 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAV1P15498 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAV1P15498 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VAV1P15498 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAV1P15498 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAV1P15498 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAV1P15498 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAV1P15498 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAV1P15498 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VAV1P15498 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VAV1P15498 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VAV1P15498 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VAV1P15498 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VAV1P15498 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VAV1P15498 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VAV1P15498 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VAV1P15498 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VAV1P15498 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VAV1P15498 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VAV1P15498 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VAV1P15498 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VAV1P15498 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VAV1P15498 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VAV1P15498 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VAV1P15498 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VAV1P15498 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VAV1P15498 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VAV1P15498 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VAV1P15498 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VAV1P15498 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VAV1P15498 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VAV1P15498 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
VAV1P15498 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VAV1P15498 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VAV1P15498 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VAV1P15498 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VAV1P15498 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VAV1P15498 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VAV1P15498 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VAV1P15498 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VAV1P15498 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAV1P15498 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAV1P15498 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAV1P15498 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAV1P15498 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAV1P15498 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VAV1P15498 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VAV1P15498 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAV1P15498 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAV1P15498 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAV1P15498 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAV1P15498 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VAV1P15498 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VAV1P15498 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAV1P15498 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAV1P15498 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAV1P15498 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VAV1P15498 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VAV1P15498 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VAV1P15498 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VAV1P15498 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAV1P15498 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VAV1P15498 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VAV1P15498 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VAV1P15498 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VAV1P15498 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VAV1P15498 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAV1P15498 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAV1P15498 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAV1P15498 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VAV1P15498 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VAV1P15498 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VAV1P15498 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VAV1P15498 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VAV1P15498 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms