Protein–RNA interactions for Protein: P14091

CTSE, Cathepsin E, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSEP14091 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTSEP14091 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTSEP14091 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTSEP14091 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTSEP14091 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTSEP14091 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTSEP14091 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTSEP14091 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTSEP14091 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CTSEP14091 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTSEP14091 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTSEP14091 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTSEP14091 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTSEP14091 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTSEP14091 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTSEP14091 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTSEP14091 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTSEP14091 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTSEP14091 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTSEP14091 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTSEP14091 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTSEP14091 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTSEP14091 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTSEP14091 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTSEP14091 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTSEP14091 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTSEP14091 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTSEP14091 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTSEP14091 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTSEP14091 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTSEP14091 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTSEP14091 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CTSEP14091 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSEP14091 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSEP14091 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSEP14091 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSEP14091 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CTSEP14091 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTSEP14091 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTSEP14091 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTSEP14091 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTSEP14091 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTSEP14091 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTSEP14091 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTSEP14091 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTSEP14091 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTSEP14091 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTSEP14091 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTSEP14091 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTSEP14091 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTSEP14091 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSEP14091 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTSEP14091 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSEP14091 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTSEP14091 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTSEP14091 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTSEP14091 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTSEP14091 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTSEP14091 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTSEP14091 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSEP14091 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTSEP14091 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTSEP14091 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTSEP14091 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CTSEP14091 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSEP14091 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTSEP14091 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CTSEP14091 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTSEP14091 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTSEP14091 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTSEP14091 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CTSEP14091 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTSEP14091 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTSEP14091 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTSEP14091 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTSEP14091 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTSEP14091 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTSEP14091 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTSEP14091 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTSEP14091 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTSEP14091 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTSEP14091 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTSEP14091 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTSEP14091 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTSEP14091 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTSEP14091 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTSEP14091 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSEP14091 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSEP14091 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSEP14091 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTSEP14091 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTSEP14091 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTSEP14091 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CTSEP14091 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTSEP14091 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSEP14091 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTSEP14091 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSEP14091 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTSEP14091 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTSEP14091 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms