Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYL1P12980 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYL1P12980 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYL1P12980 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYL1P12980 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYL1P12980 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYL1P12980 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYL1P12980 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYL1P12980 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYL1P12980 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYL1P12980 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LYL1P12980 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYL1P12980 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYL1P12980 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYL1P12980 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYL1P12980 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYL1P12980 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LYL1P12980 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LYL1P12980 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYL1P12980 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYL1P12980 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYL1P12980 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYL1P12980 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYL1P12980 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYL1P12980 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYL1P12980 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYL1P12980 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYL1P12980 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYL1P12980 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYL1P12980 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYL1P12980 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYL1P12980 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYL1P12980 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYL1P12980 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYL1P12980 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYL1P12980 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYL1P12980 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYL1P12980 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYL1P12980 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LYL1P12980 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYL1P12980 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYL1P12980 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYL1P12980 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYL1P12980 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYL1P12980 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYL1P12980 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYL1P12980 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYL1P12980 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYL1P12980 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYL1P12980 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYL1P12980 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYL1P12980 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYL1P12980 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYL1P12980 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYL1P12980 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYL1P12980 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYL1P12980 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYL1P12980 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYL1P12980 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYL1P12980 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYL1P12980 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYL1P12980 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYL1P12980 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYL1P12980 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYL1P12980 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYL1P12980 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYL1P12980 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYL1P12980 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYL1P12980 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYL1P12980 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYL1P12980 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYL1P12980 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYL1P12980 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYL1P12980 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYL1P12980 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYL1P12980 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYL1P12980 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYL1P12980 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYL1P12980 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYL1P12980 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYL1P12980 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYL1P12980 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYL1P12980 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYL1P12980 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYL1P12980 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYL1P12980 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYL1P12980 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYL1P12980 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYL1P12980 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LYL1P12980 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYL1P12980 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYL1P12980 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LYL1P12980 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYL1P12980 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LYL1P12980 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYL1P12980 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYL1P12980 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYL1P12980 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYL1P12980 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYL1P12980 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms